Na saboru u ožujku 1467. preimenovana su dva tradicionalna poreza;dobit komore nakon toga je prikupljana kao porez kraljevske riznice, a tridesetina kao carina krune.Zbog ove promjene sva dosadašnja porezna oslobođenja postala su ništavna, što je povećalo prihode države.Matija je krenuo s centralizacijom upravljanja kraljevskim prihodima.Upravu krunske carine povjerio je Johnu Ernusztu, preobraćenom židovskom trgovcu.Unutar dvije godine Ernuszt je bio odgovoran za prikupljanje svih redovnih i izvanrednih poreza, te za upravljanje rudnicima soli.Matijina porezna reforma izazvala je pobunu u Transilvaniji.Predstavnici "Tri naroda" pokrajine—plemići, Saksonci i Székelyji—formirali su savez protiv kralja u Kolozsmonostoru (danas okrug Mănăștur u Cluj-Napoci, Rumunjska) 18. kolovoza, izjavivši da su voljni borba za slobodu Ugarske.Matijaš odmah skupi svoje čete i pohita u pokrajinu.Pobunjenici su se predali bez otpora, ali je Matijaš strogo kaznio njihove vođe, od kojih su mnogi po njegovoj naredbi bili nabijeni na kolac, odrubljene glave ili nemilosrdno mučeni.Sumnjajući da je Stjepan Veliki podržao pobunu, Matija je napao Moldaviju.Međutim, Stjepanove snage porazile su Matijine u bitci kod Baije 15. prosinca 1467. Matija je pretrpio teške ozljede, zbog čega se morao vratiti u Mađarsku.