Nedugo nakon krunidbe Koloman se morao suočiti s problemima koje su prouzročile vojske Prvog križarskog rata prolazeći kroz Ugarsku.Mađarska je desetljećima bila u mogućnosti opskrbljivati ​​hranom značajan broj zapadnoeuropskih hodočasnika tijekom njihova putovanja u Svetu zemlju, no kretanje desetaka tisuća križara diljem zemlje ugrozilo je opstanak domorodaca.Prva skupina križara, predvođena Walterom Sans Avoirom, stigla je do granice početkom svibnja 1096. Koloman ih je prijateljski primio i pustio u kraljevstvo.Također ih je ovlastio da kupuju hranu na tržnicama, iako žetva još nije počela.Prošli su kroz Mađarsku bez većih sukoba.Sljedeći dolasci, na čelu s Petrom Pustinjakom, stigli su krajem svibnja ili početkom lipnja.Koloman im je dopustio ulazak u Mađarsku tek nakon što se Petar obvezao da će ih spriječiti u pljačkanju sela.Prema zapisima Guiberta od Nogenta, Petar nije mogao održati obećanje: križari su "zapalili javne žitnice ..., silovali djevice, obeščastili mnoge bračne postelje odvodeći mnoge žene", iako su "Mađari, kao kršćani kršćanima, imali velikodušno im je nudio sve na prodaju.Treća skupina križara stigla je do Nyitre (Nitra, Slovačka) i počela pljačkati regiju.Mještani su ih ubrzo protjerali.Četvrta vojska došla je do Mosona sredinom lipnja.Koloman im nije dopustio da napuste područje, bilo zato što je saznao za njihovo problematično ponašanje tijekom putovanja, bilo zato što je shvatio da bi njihovo kretanje po Ugarskoj moglo ugroziti stabilnost tamošnjeg gospodarstva.Kako bi zaplijenili hranu i vino, križari su često pljačkali obližnja naselja.Koloman ih je odlučio napasti, ali su ga zapovjednici vojske uvjerili da nagovori križare da predaju oružje i novac, obećavši im da će se tijekom puta opskrbiti hranom.Nakon što su križari razoružani, Kolomanove trupe su ih početkom srpnja napale i masakrirale kod Pannonhalme.