Porazom jonske flote u bitci kod Ladea, pobuna je zapravo okončana.Milet je bio blisko uložen, Perzijanci su "minirali zidove i upotrijebili sve sprave protiv njega, dok ga nisu posve zauzeli".Prema Herodotu, većina muškaraca je ubijena, a žene i djeca su porobljeni.Arheološki dokazi to djelomično potvrđuju, pokazujući raširene znakove razaranja i napuštanja velikog dijela grada nakon Lade.Međutim, neki Miležani su ostali u (ili su se brzo vratili) u Milet, iako grad nikada neće povratiti svoju nekadašnju veličinu.Milet je tako pojmovno "ostavljen bez Miležana";Perzijanci su za sebe uzeli grad i priobalno zemljište, a ostatak mileškog teritorija dali Karijcima iz Pedaza.Zarobljeni Miležani dovedeni su pred Darija u Suzu, koji ih je smjestio u "Ampé" na obali Perzijskog zaljeva, blizu ušća Tigrisa.Mnogi Samci bili su zgroženi postupcima svojih generala u Ladeu i odlučili su emigrirati prije nego što se njihov stari tiranin, Aeaces od Samosa, vrati da njima vlada.Prihvatili su poziv naroda Zanclea da se nasele na obali Sicilije, a sa sobom su poveli i Miležane koji su uspjeli pobjeći od Perzijanaca.Sam Samos je bio pošteđen od uništenja od strane Perzijanaca zbog Samijskog prebjega kod Lade.Veći dio Karije sada se predao Perzijancima, iako su neka uporišta morala biti zarobljena silom.