Lee, bien qu'il soit en infériorité numérique dans un rapport de plus de deux contre un, a sans doute remporté sa plus grande victoire de la guerre, parfois décrite comme sa « bataille parfaite ».^[25] Mais il en paya un prix terrible, subissant plus de pertes qu'il n'en avait perdu dans n'importe quelle bataille précédente, y compris la défaite confédérée à la bataille d'Antietam .Avec seulement 60 000 hommes engagés, il a subi 13 303 pertes (1 665 tués, 9 081 blessés, 2 018 disparus), ^[34] perdant environ 22 % de ses effectifs dans la campagne - des hommes que la Confédération, avec ses effectifs limités, ne pouvait pas remplacer.Tout aussi sérieusement, il a perdu son commandant de terrain le plus agressif, Stonewall Jackson.Brick.Le général Elisha F. Paxton était l'autre général confédéré tué pendant la bataille.Après que Longstreet ait rejoint l'armée principale, il était très critique de la stratégie de Lee, affirmant que des batailles comme Chancellorsville coûtaient à la Confédération plus d'hommes qu'elle ne pouvait se permettre d'en perdre.^[26]Hooker, qui a commencé la campagne en croyant qu'il avait "80 chances sur 100 de réussir", a perdu la bataille à cause d'une mauvaise communication, de l'incompétence de certains de ses principaux généraux (notamment Howard et Stoneman, mais aussi Sedgwick), mais surtout à cause de l'effondrement. de sa propre confiance.Les erreurs de Hooker comprenaient l'abandon de sa poussée offensive le 1er mai et l'ordre de Sickles d'abandonner Hazel Grove et de se retirer le 2 mai. Il a également commis une erreur dans sa disposition des forces;malgré l'exhortation d'Abraham Lincoln, « cette fois, mettez tous vos hommes », quelque 40 000 hommes de l'armée du Potomac tirent à peine un coup de feu.L'Union a été choquée par la défaite.Le président Abraham Lincoln a été cité comme disant: "Mon Dieu! Mon Dieu! Que dira le pays?"Quelques généraux étaient des victimes de carrière.Le président Lincoln a choisi de conserver Hooker à la tête de l'armée, mais les frictions entre Lincoln, le général en chef Henry W. Halleck, et Hooker sont devenues intolérables au début de ce qui allait devenir la campagne de Gettysburg et Lincoln a relevé Hooker du commandement. 28 juin, juste avant la bataille de Gettysburg .Le public confédéré avait des sentiments mitigés quant au résultat, la joie de la victoire tactique de Lee tempérée par la perte de leur général le plus aimé, Stonewall Jackson.La mort de Jackson a poussé Lee à procéder à la réorganisation nécessaire depuis longtemps de l'armée de Virginie du Nord de deux grands corps en trois, sous James Longstreet, Richard S. Ewell et AP Hill.Les nouvelles affectations de ces deux derniers généraux ont causé des difficultés de commandement lors de la prochaine campagne de Gettysburg, qui a commencé en juin.Plus importante pour Gettysburg, cependant, était la confiance suprême que Lee avait acquise de sa grande victoire à Chancellorsville, que son armée était pratiquement invincible et réussirait tout ce qu'il lui demanderait de faire.^[27]