Inkvisition pyhän viraston tuomioistuin alkoi
Reconquistan loppupuolella, ja sen tarkoituksena oli säilyttää katolinen ortodoksisuus valtakunnissaan ja korvata paavin hallinnassa ollut keskiaikainen inkvisitio.Siitä tuli olennaisin laajemman katolisen inkvisition kolmesta eri ilmenemismuodosta yhdessä roomalaisen ja portugalilaisen inkvisition kanssa."Espanjalainen inkvisitio" voidaan määritellä laajasti siten, että se toimii Espanjassa ja kaikilla Espanjan siirtomailla ja alueilla, mukaan lukien Kanariansaaret, Napolin kuningaskunta ja kaikki Espanjan omaisuus Pohjois-, Keski- ja Etelä-Amerikassa.Nykyaikaisten arvioiden mukaan noin 150 000 ihmistä asetettiin syytteeseen erilaisista rikoksista Espanjan inkvisition kolmen vuosisadan keston aikana, joista 3 000 - 5 000 teloitettiin.Inkvisitio oli alun perin tarkoitettu ensisijaisesti tunnistamaan harhaoppiset
juutalaisuudesta ja islamista katolilaisuuteen kääntyneiden joukossa.Äskettäin kääntyneiden katolilaisten uskon säätely tiivistyi sen jälkeen, kun vuosina 1492 ja 1502 annetut kuninkaalliset säädökset käskivät juutalaisia ja muslimeja kääntymään katolilaisuuteen tai jättämään Kastilia, mikä johti satojen tuhansien pakkokäännyksiin, conversojen ja moriscojen vainoon ja juutalaisten ja muslimien joukkokarkotukset Espanjasta.Inkvisitio lakkautettiin vuonna 1834, Isabella II:n hallituskaudella, edellisen vuosisadan vaikutusvallan heikkenemisen jälkeen.