Μερικοί Ούγγροι ευγενείς πρότειναν ο Φερδινάνδος, ο οποίος ήταν ο ηγεμόνας της γειτονικής Αυστρίας και ήταν συνδεδεμένος με την οικογένεια του Λουδοβίκου Β', να γίνει βασιλιάς της Ουγγαρίας, επικαλούμενοι προηγούμενες συμφωνίες ότι οι Αψβούργοι θα έπαιρναν τον ουγγρικό θρόνο εάν ο Λουδοβίκος πέθαινε χωρίς κληρονόμους.Ωστόσο, άλλοι ευγενείς στράφηκαν στον ευγενή John Zápolya, τον οποίο υποστήριζε ο Σουλεϊμάν.Υπό τον Κάρολο Ε' και τον αδελφό του Φερδινάνδο Α', οι Αψβούργοι κατέλαβαν ξανά τη Βούδα και κατέλαβαν την Ουγγαρία.Ο Ζάπολια αρνήθηκε να εγκαταλείψει τις αξιώσεις του για τον ουγγρικό θρόνο και ως εκ τούτου ζήτησε από τον Σουλεϊμάν αναγνώριση σε αντάλλαγμα για φόρο τιμής.Ο Σουλεϊμάν αποδέχτηκε τη Ζαπόλια ως υποτελή του τον Φεβρουάριο και τον Μάιο του 1529 ο Σουλεϊμάν ξεκίνησε προσωπικά την εκστρατεία του. Στις 26–27 Αυγούστου ο Σουλεϊμάν είχε περικυκλώσει τη Βούδα και άρχισε η πολιορκία.Τα τείχη καταστράφηκαν από έντονες πυροβολισμούς κανονιών και όπλων των Οθωμανών μεταξύ 5 και 7 Σεπτεμβρίου.Η στρατιωτική ετοιμότητα, οι αδιάκοπες επιθέσεις και η σωματική και ψυχολογική καταστροφή που προκλήθηκε από το οθωμανικό πυροβολικό είχαν το επιθυμητό αποτέλεσμα.Οι Γερμανοί μισθοφόροι παραδόθηκαν και παραχώρησαν το κάστρο στους Οθωμανούς στις 8 Σεπτεμβρίου.Ο John Zápolya εγκαταστάθηκε στη Βούδα ως υποτελής του Σουλεϊμάν. Μετά την ήττα του Φερδινάνδου υποσχέθηκε στους υποστηρικτές του ασφαλή διέλευση από την πόλη, ωστόσο τα οθωμανικά στρατεύματα τους έσφαξαν έξω από τα τείχη της πόλης.