Οι επιδεινόμενες οικονομικές δυσκολίες ήταν νέες στρατιωτικές προκλήσεις.Στα τέλη της δεκαετίας του 1970, η Καμπότζη υπό το καθεστώς των Ερυθρών Χμερ άρχισε να παρενοχλεί και να επιδρομές σε βιετναμέζικα χωριά στα κοινά σύνορα.Μέχρι το τέλος του 1978, οι Βιετναμέζοι ηγέτες αποφάσισαν να απομακρύνουν την κυβέρνηση της Δημοκρατικής Καμπουτσέα που κυριαρχείται από τους Ερυθρούς Χμερ, θεωρώντας την ως φιλοκινεζική και εχθρική προς το Βιετνάμ.Στις 25 Δεκεμβρίου 1978, 150.000 Βιετναμέζοι στρατιώτες εισέβαλαν στη Δημοκρατική Καμπότζια και κατέλαβαν τον Επαναστατικό Στρατό της Καμπότζης σε μόλις δύο εβδομάδες, τερματίζοντας έτσι την κυβέρνηση του Πολ Ποτ, η οποία ήταν υπεύθυνη για τους θανάτους σχεδόν του ενός τέταρτου όλων των Καμποτζιανών μεταξύ 1975 και Δεκεμβρίου 197. γενοκτονία.Η στρατιωτική επέμβαση του Βιετνάμ και η επακόλουθη διευκόλυνση των δυνάμεων κατοχής της διεθνούς επισιτιστικής βοήθειας για τον μετριασμό του τεράστιου λιμού, τερμάτισαν τη γενοκτονία.^[220]Στις 8 Ιανουαρίου 1979 ιδρύθηκε στην Πνομ Πενχ η φιλοβιετναμική Λαϊκή Δημοκρατία της Καμπουτσέα (PRK), σηματοδοτώντας την αρχή μιας δεκαετούς βιετναμέζικης κατοχής.Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, η Δημοκρατική Καμπούτσια των Ερυθρών Χμερ συνέχισε να αναγνωρίζεται από τα Ηνωμένα Έθνη ως η νόμιμη κυβέρνηση της Καμπούτσια, καθώς πολλές ένοπλες ομάδες αντίστασης σχηματίστηκαν για να πολεμήσουν την κατοχή του Βιετνάμ.Καθ' όλη τη διάρκεια της σύγκρουσης, αυτές οι ομάδες έλαβαν εκπαίδευση στην Ταϊλάνδη από την Ειδική Αεροπορική Υπηρεσία του Βρετανικού Στρατού.^[221] Στα παρασκήνια, ο πρωθυπουργός Χουν Σεν της κυβέρνησης της PRK πλησίασε φατρίες της Κυβέρνησης Συνασπισμού της Δημοκρατικής Καμπούτζας (CGDK) για να ξεκινήσουν ειρηνευτικές συνομιλίες.Κάτω από διπλωματική και οικονομική πίεση από τη διεθνή κοινότητα, η κυβέρνηση του Βιετνάμ εφάρμοσε μια σειρά από μεταρρυθμίσεις στην οικονομική και εξωτερική πολιτική και αποχώρησε από την Καμπούτσια τον Σεπτέμβριο του 1989.