Στη δεκαετία του 1990, το στρατιωτικό καθεστώς της Μιανμάρ συνέχισε να ασκεί τον έλεγχο παρά το γεγονός ότι ο Εθνικός Σύνδεσμος για τη Δημοκρατία (NLD) κέρδισε τις πολυκομματικές εκλογές το 1990. Οι ηγέτες του NLD Tin Oo και Aung San Suu Kyi κρατήθηκαν σε κατ' οίκον περιορισμό και ο στρατός αντιμετώπισε αυξανόμενη διεθνή πίεση μετά τη Suu Ο Kyi κέρδισε το Νόμπελ Ειρήνης το 1991. Αντικαθιστώντας τον Saw Maung με τον στρατηγό Than Shwe το 1992, το καθεστώς χαλάρωσε ορισμένους περιορισμούς, αλλά διατήρησε την εξουσία του, συμπεριλαμβανομένων των προσπαθειών για σύνταξη νέου συντάγματος.Καθ' όλη τη διάρκεια της δεκαετίας, το καθεστώς έπρεπε να αντιμετωπίσει διάφορες εθνοτικές εξεγέρσεις.Σημαντικές συμφωνίες κατάπαυσης του πυρός έγιναν διαπραγματεύσεις με αρκετές φυλετικές ομάδες, αν και μια διαρκής ειρήνη με την εθνοτική ομάδα Karen παρέμενε άπιαστη.Επιπλέον, η πίεση των ΗΠΑ οδήγησε σε συμφωνία με τον Khun Sa, έναν πολέμαρχο του οπίου, το 1995. Παρά τις προκλήσεις αυτές, υπήρξαν προσπάθειες εκσυγχρονισμού του στρατιωτικού καθεστώτος, συμπεριλαμβανομένης της αλλαγής του ονόματος σε State Peace and Development Council (SPDC) το 1997 και μετακίνησης την πρωτεύουσα από τη Γιανγκόν στο Ναυπιντάου το 2005.Η κυβέρνηση ανακοίνωσε έναν «οδικό χάρτη προς τη δημοκρατία» επτά βημάτων το 2003, αλλά δεν υπήρχε χρονοδιάγραμμα ή διαδικασία επαλήθευσης, κάτι που οδήγησε σε σκεπτικισμό από διεθνείς παρατηρητές.Η Εθνική Συνέλευση συνήλθε εκ νέου το 2005 για να ξαναγράψει το Σύνταγμα, αλλά απέκλεισε μεγάλες ομάδες υπέρ της δημοκρατίας, οδηγώντας σε περαιτέρω κριτική.Οι παραβιάσεις των ανθρωπίνων δικαιωμάτων, συμπεριλαμβανομένης της καταναγκαστικής εργασίας, οδήγησαν τη Διεθνή Οργάνωση Εργασίας να επιδιώξει τη δίωξη μελών της χούντας για εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας το 2006 ^[90]