Η Μεσοποταμία κατακτήθηκε από τους Αχαιμενίδες Πέρσες υπό τον Κύρο τον Μέγα το 539 π.Χ. και παρέμεινε υπό περσική κυριαρχία για δύο αιώνες.Για δύο αιώνες κυριαρχίας των Αχαιμενιδών τόσο η Ασσυρία όσο και η Βαβυλωνία άκμασαν, η Αχαιμενιδική Ασσυρία ιδιαίτερα έγινε μια σημαντική πηγή ανθρώπινου δυναμικού για τον στρατό και ένα καλάθι για την οικονομία.Τα αραμαϊκά της Μεσοποταμίας παρέμειναν η γλώσσα της Αχαιμενιδικής Αυτοκρατορίας, όπως και στους Ασσυριακούς χρόνους.Οι Αχαιμενίδες Πέρσες, σε αντίθεση με τους Νεο-Ασσύριους, παρενέβησαν ελάχιστα στις εσωτερικές υποθέσεις των εδαφών τους, εστιάζοντας αντ' αυτού στη συνεπή ροή φόρου και φόρου.^[40]Η Αθούρα, γνωστή ως Ασσυρία στην Αχαιμενιδική Αυτοκρατορία, ήταν μια περιοχή στην Άνω Μεσοποταμία από το 539 έως το 330 π.Χ.Λειτουργούσε ως στρατιωτικό προτεκτοράτο παρά ως παραδοσιακή σατραπεία.Οι επιγραφές των Αχαιμενιδών περιγράφουν την Ατούρα ως «ντάχιου», που ερμηνεύεται ως μια ομάδα ανθρώπων ή μια χώρα και οι λαοί της, χωρίς διοικητικές επιπτώσεις.^[41] Η Αθούρα περιελάμβανε τα περισσότερα από τα εδάφη της πρώην Νεο-Ασσυριακής Αυτοκρατορίας, τώρα τμήματα του βόρειου Ιράκ, του βορειοδυτικού Ιράν, της βορειοανατολικής Συρίας και της νοτιοανατολικής Ανατολίας, αλλά απέκλειετην Αίγυπτο και τη χερσόνησο του Σινά.^[42] Ασσύριοι στρατιώτες ήταν εξέχοντες στον στρατό των Αχαιμενιδών ως βαρύ πεζικό.^[43] Παρά τις αρχικές καταστροφές, η Αθούρα ήταν μια ευημερούσα περιοχή, ειδικά στη γεωργία, έρχεται σε αντίθεση με τις προηγούμενες πεποιθήσεις ότι ήταν έρημο.^[42]