След Кулоден правителствените сили прекараха няколко седмици в издирване на бунтовници, конфискуване на добитък и изгаряне на несъдебни епископални и католически събрания.Бруталността на тези мерки беше продиктувана от широко разпространеното схващане и от двете страни, че ново кацане е неизбежно.Редовните войници на френска служба са третирани като военнопленници и по-късно разменени, независимо от националността им, но 3500 пленени якобити са обвинени в държавна измяна.От тях 120 са екзекутирани, предимно дезертьори и членове на Манчестърския полк.Около 650 загинаха в очакване на процеса;900 са помилвани, а останалите транспортирани.