На общите избори през 1990 г. десният консервативен алианс, Ислямският демократичен алианс (IDA), воден от Наваз Шариф, получи достатъчно подкрепа, за да състави правителство.Това бележи първия път, когато десен консервативен съюз пое властта при демократична система в Пакистан.Администрацията на Шариф се фокусира върху справяне със стагфлацията в страната чрез прилагане на политики на приватизация и икономическа либерализация.Освен това правителството му поддържаше политика на неяснота по отношение на пакистанските програми за атомна бомба.По време на мандата си Шариф въвлича Пакистан във войната в Персийския залив през 1991 г. и започва военна операция срещу либералните сили в Карачи през 1992 г. Въпреки това правителството му е изправено пред институционални предизвикателства, особено с президента Гулам Хан.Хан се опита да отхвърли Шариф, използвайки подобни обвинения, които преди това беше повдигнал срещу Беназир Бхуто.Първоначално Шариф беше свален, но беше възстановен на власт след решение на Върховния съд.В политическа маневра Шариф и Бхуто си сътрудничат, за да отстранят президента Хан от поста.Въпреки това мандатът на Шариф беше кратък, тъй като в крайна сметка той беше принуден да се оттегли поради натиск от страна на военното ръководство.