Раджа Хиджау, Зелената кралица, се възкачи на трона на Патани през 1584 г. поради липса на мъжки наследници.Тя призна властта на Сиам и прие титлата перакау.Под нейното управление, продължило 32 години, Патани просперира, превръщайки се в културен център и виден търговски център.Китайски, малайски, сиамски, португалски, японски, холандски и английски търговци посещавали Патани, допринасяйки за неговия икономически растеж.По-специално китайските търговци изиграха централна роля за възхода на Патани като търговски център, а европейските търговци гледаха на Патани като на врата към китайския пазар.След царуването на Раджа Хиджау, Патани е управляван от поредица от кралици, включително Раджа Биру (Синята кралица), Раджа Унгу (Пурпурната кралица) и Раджа Кунинг (Жълтата кралица).Раджа Биру включва Келантанския султанат в Патани, докато Раджа Унгу създава съюзи и се противопоставя на сиамското господство, което води до конфликти със Сиам.Управлението на Раджа Кунинг бележи спад във властта и влиянието на Патани.Тя търси помирение със сиамците, но нейното управление е белязано от политическа нестабилност и спад в търговията.До средата на 17-ти век властта на кралиците Патани е намаляла и политическите безредици измъчват региона.Твърди се, че Раджа Кунинг е бил свален от власт от Раджа на Келантан през 1651 г., поставяйки началото на династията Келантанезе в Патани.Регионът е изправен пред бунтове и нашествия, най-вече от Аютая.До края на 17 век политическите вълнения и беззаконието обезсърчават чуждестранните търговци да търгуват с Patani, което води до упадъка му, както е описано в китайски източници.