След еламската окупация на Вавилония, регионът видя значителни политически промени, като се започне с основаването на Династия IV на Вавилон от Мардук-кабит-ахешу около 1155 г. пр.н.е.Тази династия, произхождаща от Исин, ​​се отличава с това, че е първата местна династия от Южна Месопотамия, говореща акадски език, управлявала Вавилония.Мардук-кабит-ахешу, едва вторият местен месопотамец след асирийския цар Тукулти-Нинурта I, управлявал Вавилон, успешно изгонва еламите и предотвратява каситското възраждане.Неговото царуване също видя конфликт с Асирия, превземайки Екалатум, преди да бъде победен от Ашур-Дан I.Ити-Мардук-балату, наследил баща си през 1138 г. пр. н. е., отблъснал еламските атаки по време на 8-годишното си управление.Опитите му да атакува Асирия обаче завършват с неуспех срещу все още управляващия Ашур-Дан I. Нинурта-надин-шуми, възкачващ се на трона през 1127 г. пр.н.е., също предприема военни кампании срещу Асирия.Неговото амбициозно нападение срещу асирийския град Арбела завършва с поражение от Ашур-реш-иши I, който след това налага благоприятен за Асирия договор.Навуходоносор I (1124–1103 г. пр.н.е.), най-известният владетел от тази династия, постига значителни победи срещу Елам, възвръщайки си територии и свещената статуя на Мардук.Въпреки успеха си срещу Елам, той претърпя множество поражения от Ашур-реш-иши I в опитите си да се разшири в територии, контролирани преди това от хетите.По-късните години на Навуходоносор I са съсредоточени върху изграждането и укрепването на границите на Вавилон.Навуходоносор I е последван от Енлил-надин-апли (1103–1100 г. пр. н. е.) и Мардук-надин-ахе (1098–1081 г. пр. н. е.), като и двамата участват в конфликти с Асирия.Първоначалните успехи на Marduk-nadin-ahhe бяха засенчени от съкрушителни поражения от Tiglath-Pileser I, което доведе до значителни териториални загуби и глад във Вавилон.Мардук-шапик-зери (около 1072 г. пр. н. е.) успява да подпише мирен договор с Асирия, но неговият приемник, Кадашман-Буриаш, се сблъсква с асирийска враждебност, което води до асирийско господство до около 1050 г. пр. н. е.Последвалите вавилонски владетели като Marduk-ahhe-eriba и Marduk-zer-X са по същество васали на Асирия.Упадъкът на Средноасирийската империя около 1050 г. пр. н. е., дължащ се на вътрешни борби и външни конфликти, позволи на Вавилония да се освободи от асирийския контрол.Въпреки това, този период също видя нахлуването на западносемитски номадски народи, особено арамейци и сутеанци, които се заселиха в големи части от вавилонската територия, което показва политическата и военна уязвимост на региона.