През 1241–1242 г. кралството претърпява сериозен удар в резултат на монголското нашествие в Европа.След като Унгария е нападната от монголите през 1241 г., унгарската армия е победена катастрофално в битката при Мохи.Крал Бела IV бяга от бойното поле, а след това и от страната, след като монголите го преследват до нейните граници.Преди монголците да се оттеглят, голяма част от населението (20-50%) умира.^[22] В равнините между 50 и 80% от селищата са унищожени.^[23] Само замъци, силно укрепени градове и абатства могат да издържат на атаката, тъй като монголите нямат време за дълги обсади — целта им е да се придвижат на запад възможно най-скоро.Обсадните машини икитайските и персийските инженери, които ги управляваха за монголите, бяха оставени в завладените земи на Киевска Рус.^[24] Опустошението, причинено от монголските нашествия, по-късно доведе до поканата на заселници от други части на Европа, особено от Германия.По време на кампанията на монголите срещу Киевска Рус, около 40 000 кумани , членове на номадско племе от езически кипчаки, са прогонени на запад от Карпатите.^[25] Там куманите се обръщат към крал Бела IV за защита.^[26] Иранските ясици идват в Унгария заедно с куманите, след като са победени от монголите.Куманите съставляват може би до 7–8% от населението на Унгария през втората половина на 13 век.^[27] През вековете те са били напълно асимилирани в унгарското население и езикът им е изчезнал, но са запазили своята идентичност и своята регионална автономия до 1876 г. ^[28]Като следствие от монголските нашествия, крал Бела нарежда изграждането на стотици каменни замъци и укрепления, за да помогне за защита срещу евентуално второ монголско нашествие.Монголците наистина се завръщат в Унгария през 1286 г., но новопостроените системи от каменни замъци и новите военни тактики, включващи по-голям дял тежко въоръжени рицари, ги спират.Нахлуващите монголски сили са победени близо до Пеща от кралската армия на крал Ладислав IV.По-късните нашествия също бяха отблъснати сръчно.Замъците, построени от Бела IV, се оказват много полезни по-късно в дългата борба срещу Османската империя .Разходите за построяването им обаче задължиха унгарския крал към големите феодални земевладелци, така че кралската власт, възвърната от Бела IV, след като баща му Андрей II значително отслабна, отново беше разпръсната сред по-ниското благородство.