Джаксън научава в 7 часа сутринта, че федералните се приближават към неговата колона.Без подходящо разузнаване или изчакване по-голямата част от силите му да се издигнат, той заповяда на Стоунуолската бригада на Уиндър да атакува през разреждащата се мъгла.Бригадата беше хваната между артилерията на фланга и огневи залпове отпред и отстъпи в безпорядък.Бяха се натъкнали на две бригади в авангарда на армията на Шийлдс, 3000 души под командването на Бриг.Ген. Ераст Б. Тайлър.Опитвайки се да се измъкне от потенциално бедствие, Джаксън осъзнава, че артилерийският огън на Съюза идва от разклонението на Синия хребет.Джаксън и Уиндър изпращат 2-ри и 4-ти пехотен полк на Вирджиния през гъстите шубраци нагоре по хълма, където се натъкват на три пехотни полка на Съюза, подкрепящи артилерията, и са отблъснати.След като атаката му срещу Коулинг се проваля, Джаксън нарежда на останалата част от дивизията на Юел, главно на бригадата на Тримбъл, да преминат през моста на Северната река и да го изгорят зад тях, като държат хората на Фремонт изолирани на север от реката.Докато чакаше тези войски да пристигнат, Джаксън подсили линията си със 7-ма пехота на Луизиана от бригадата на Тейлър и нареди на Тейлър да направи нов опит срещу батареите на Съюза.Уиндър усеща, че федералните са на път да атакуват, така че нарежда превантивна атака, но изправена пред залпове от упор и изчерпване на боеприпасите, бригадата Стоунуол е разгромена.В този момент Юел пристигна на бойното поле и нареди на 44-ти и 58-ми пехотен полк на Вирджиния да ударят левия фланг на напредващата бойна линия на Съюза.Хората на Тайлър отстъпиха, но се реорганизираха и изгониха хората на Юел в гората на юг от Коулинг.Тейлър атакува пехотата и артилерията на Коулинг три пъти, преди да надделее, но след като постигнаха целта си, бяха изправени пред нова атака от три полка в Охайо.Само изненадващото появяване на войските на Юел убеди Тайлър да изтегли хората си.Конфедератите започнаха да бомбардират войските на Съюза в равнинните земи, като самият Юел радостно управляваше едно от оръдията.Започнаха да пристигат още подкрепления от Конфедерацията, включително бригадата от Бриг.Ген. Уилям Б. Талиаферо и армията на Съюза неохотно започва да се оттегля.Джаксън отбеляза на Юел: „Генерал, този, който не вижда Божията ръка в това, е сляп, сър, сляп.“Напрегнатостта на Джаксън го бе подтикнала да атакува, преди войските му да са достатъчно натрупани, което беше затруднено от недостатъчните средства за пресичане на реката.Битката при Порт Република беше лошо управлявана от Джаксън и беше най-вредната за Конфедератите по отношение на жертви - 816 срещу сила, половината от неговия размер (около 6000 до 3500).Загубите на съюза са 1002, като висок процент представляват затворници.След двойните поражения при Крос Кийс и Порт Република, армиите на Съюза се оттеглят, оставяйки Джаксън да контролира горната и средната долина Шенандоа и освобождава армията си, за да подсили Робърт Е. Лий преди Ричмънд в Седемдневните битки.