7 yanvar 1598-ci ildə övladı olmayan Fedorun ölümü, həmçinin Fedorun daha kiçik qardaşı Dimitrinin şayiələrə görə öldürülməsi Borisin hakimiyyətə gəlməsinə səbəb oldu.Onun seçilməsini Moskva Patriarxı Əyyub təklif etdi və o, Borisin vəziyyətin çətinliklərinin öhdəsindən gələ biləcək tək adam olduğuna inanırdı.Boris isə taxtı yalnız fevralın 17-də toplanan və fevralın 21-də yekdilliklə seçən Zemski Sobordan (milli məclisdən) qəbul edəcəkdi.Sentyabrın 1-də ona təntənəli şəkildə çar tacı verildi.O, Rusiyanın Qərbin intellektual tərəqqisinə yetişməsinin zəruriliyini dərk etdi və təhsil və sosial islahatların aparılması üçün əlindən gələni etdi.O, böyük miqyasda əcnəbi müəllimləri ölkəyə gətirən ilk çar, rus gənclərini təhsil almaq üçün xaricə göndərən və Rusiyada lüteran kilsələrinin tikintisinə icazə verən ilk çar idi.