Thaksin'in Tay Rak Thai Partiyası 2001-ci ildə ümumi seçkilər vasitəsilə hakimiyyətə gəldi və burada Nümayəndələr Palatasında demək olar ki, çoxluğu qazandı.Baş nazir olaraq, Thaksin, daxili istehlakı təşviq etməyə və xüsusilə kənd əhalisini kapitalla təmin etməyə yönəlmiş məşhur "Taksinomika" adlı bir siyasət platformasını işə saldı.Seçki vədlərini, o cümlədən One Tambon One Product layihəsi və 30 bahtlıq universal səhiyyə sxemi kimi populist siyasətləri yerinə yetirməklə, onun hökuməti, xüsusən də iqtisadiyyat 1997-ci il Asiya maliyyə böhranının təsirlərindən sağaldıqda yüksək bəyənmə qazandı.Thaksin dörd illik səlahiyyət müddətini başa vuran ilk demokratik seçilmiş baş nazir oldu və Thai Rak Thai 2005-ci ildə keçirilən ümumi seçkilərdə böyük qələbə qazandı.^[77]Bununla belə, Thaksin hakimiyyəti mübahisələrlə də yadda qaldı.O, idarəetmədə, hakimiyyətin mərkəzləşdirilməsində və bürokratiyanın əməliyyatlarına müdaxilənin artırılmasında avtoritar “CEO tərzi” yanaşmasını mənimsəmişdi.1997-ci il konstitusiyası hökumətin daha çox sabitliyini təmin etsə də, Thaksin öz təsirindən hökumətə qarşı nəzarət və tarazlıq funksiyası daşıyan müstəqil qurumları zərərsizləşdirmək üçün də istifadə etdi.O, tənqidçiləri hədələdi və medianı manipulyasiya edərək yalnız müsbət şərhlər etdi.2000-dən çox məhkəməsiz qətllə nəticələnən "narkotiklərə qarşı müharibə" ilə insan hüquqları ümumilikdə pisləşdi.Thaksin, Cənubi Tayland üsyanına yüksək qarşıdurma yanaşması ilə cavab verdi və nəticədə zorakılıqda nəzərəçarpacaq artım oldu.^[78]Thaksin hökumətinə qarşı ictimai müxalifət 2006-cı ilin yanvarında Thaksin ailəsinin Shin Corporation-dakı səhmlərinin Temasek Holdings-ə satılması ilə daha da gücləndi.Media maqnatı Sondhi Limthongkulun başçılıq etdiyi Demokratiya Uğrunda Xalq Alyansı (PAD) kimi tanınan qrup Taksini korrupsiyada ittiham edərək müntəzəm kütləvi aksiyalar keçirməyə başladı.Ölkə siyasi böhran vəziyyətinə düşdükcə, Thaksin Nümayəndələr Palatasını buraxdı və apreldə ümumi seçki keçirildi.Lakin Demokrat Partiyasının başçılıq etdiyi müxalifət partiyaları seçkini boykot edib.PAD etirazlarını davam etdirdi və Tay Rak Thai seçkidə qalib gəlsə də, səsvermə kabinələrinin təşkilində dəyişiklik edildiyi üçün nəticələr Konstitusiya Məhkəməsi tərəfindən ləğv edildi.Oktyabr ayına yeni seçki təyin olundu və 9 iyun 2006-cı ildə ölkə Kral Bhumibolun almaz yubileyini qeyd edərkən, Thaksin müvəqqəti hökumətin başçısı vəzifəsini davam etdirdi ^{[. 79]}