David Marshall, Hock Lee avtobus iğtişaşları kimi hadisələrlə nümunə olaraq sosial iğtişaşlarla üzləşən qeyri-sabit hökumətə rəhbərlik edən Sinqapurun ilk Baş Naziri oldu.1956-cı ildə o, tam özünü idarə etmək üçün Londonda danışıqlara başçılıq etdi, lakin danışıqlar Britaniyanın təhlükəsizliyi ilə bağlı narahatlıqlar səbəbindən uğursuzluğa düçar oldu və onun istefasına səbəb oldu.Onun varisi Lim Yu Hok kommunist və solçu qruplara qarşı sərt mövqe tutaraq, ingilislərin 1958-ci ildə Sinqapura tam daxili özünüidarəetmə imkanı verməsinin yolunu açdı.1959-cu il seçkilərində Li Kuan Yu-nun rəhbərlik etdiyi Xalq Fəaliyyəti Partiyası (PAP) qalib gəldi və Li Sinqapurun ilk baş naziri oldu.Onun hökuməti partiyanın kommunist tərəfdarı fraksiyasına görə ilkin skeptisizmlə üzləşdi və biznesin Kuala-Lumpura köçürülməsinə səbəb oldu.Bununla belə, Linin rəhbərliyi altında Sinqapur iqtisadi artım, təhsil islahatları və aqressiv ictimai mənzil proqramı gördü.Hökumət həmçinin əmək iğtişaşlarının qarşısını almaq və ingilis dilini təbliğ etmək üçün tədbirlər gördü.Bu nailiyyətlərə baxmayaraq, PAP liderləri Sinqapurun gələcəyinin Malaya ilə birləşmə ilə bağlı olduğuna inanırdılar.İdeya çətinliklərlə, xüsusən PAP daxilindəki kommunistlərin müxalifəti və Malaya Birləşmiş Malayziya Milli Təşkilatının irqi güc balansı ilə bağlı narahatlıqları ilə dolu idi.Bununla belə, Sinqapurda kommunistlərin ələ keçirilməsi perspektivi birləşmənin lehinə hissləri dəyişdi.1961-ci ildə Malaya baş naziri Tunku Əbdül Rəhman Malayziya, Sinqapur, Bruney, Şimali Borneo və Saravakın daxil olduğu Malayziya Federasiyasını təklif etdi.1962-ci ildə Sinqapurda keçirilən növbəti referendum xüsusi muxtariyyət şərtləri altında birləşməyə güclü dəstək göstərdi.