1965-ci ildə artan gərginliklə üzləşən və gələcək münaqişənin qarşısını almaq üçün Malayziyanın Baş naziri Tunku Əbdül Rəhman Sinqapurun Malayziyadan çıxarılmasını təklif etdi.Bu tövsiyə sonradan Malayziya Parlamenti tərəfindən 9 avqust 1965-ci ildə Sinqapurun ayrılmasının lehinə yekdilliklə səsvermə ilə təsdiq edildi.Elə həmin gün Sinqapurun baş naziri Li Kuan Yu emosional olaraq şəhər dövlətinin yeni müstəqilliyini elan etdi.Sinqapurun birtərəfli qaydada qovulması ilə bağlı yayılmış inancın əksinə olaraq, son sənədlər Sinqapur Xalq Fəaliyyət Partiyası (PAP) ilə Malayziya Alyansı arasında müzakirələrin 1964-cü ilin iyul ayından bəri davam etdiyini ortaya qoyur. Ayrılıq həm siyasi, həm də iqtisadi fayda gətirməyi hədəfləyən, geri alınmaz bir qərar olaraq ictimaiyyətə təqdim edildi.^[16]Ayrılmadan sonra Sinqapur, şəhər dövlətini Sinqapur Respublikasına çevirən konstitusiya dəyişikliklərinə məruz qaldı.Əvvəllər Yang di-Pertuan Neqara və ya vitse-kral nümayəndəsi olan Yusof İshak Sinqapurun ilk prezidenti kimi andiçmə mərasimi keçirdi.Malaya və Britaniya Borneo dolları qısa müddət ərzində qanuni valyuta kimi davam etsə də, Sinqapur və Malayziya arasında ortaq valyuta haqqında müzakirələr ^[1967] -ci ildə Sinqapur dollarının son dövriyyəyə buraxılmasından əvvəl aparıldı. Sinqapur tərəfindən Malayaya yenidən bölüşdürüldü, bu da Sabah və Saravak əyalətlərinin əlində olan güc və təsir balansını dəyişdirdi.Sinqapurun Malayziyadan ayrılması qərarı xüsusilə Sabah və Saravak liderləri tərəfindən sərt reaksiyalarla qarşılanıb.Bu liderlər ayrılıq prosesində məsləhət görülmədiklərinə görə xəyanət və məyusluq hisslərini dilə gətiriblər. Sabahın baş naziri Fuad Stivens Li Kuan Yuya yazdığı məktubda dərin hüznünü ifadə edərkən, Saravak Birləşmiş Xalq Partiyasından Ong Kee Hui kimi liderlər sorğu-sual etdi. Malayziyanın ayrılıqdan sonrakı mövcudluğunun əsas səbəbi.Bu narahatlıqlara baxmayaraq, Malayziyanın baş nazirinin müavini Əbdül Rəzak Hüseyn hərəkətin məxfiliyini və təcililiyini davam edən İndoneziya-Malayziya qarşıdurması ilə əlaqələndirərək qərarı müdafiə etdi.^[18]