Konfrontasi kimi də tanınan İndoneziya-Malayziya qarşıdurması 1963-1966-cı illərdə İndoneziyanın Malaya Federasiyası, Sinqapur və Şimali Borneo və Saravakdakı Britaniya koloniyalarını birləşdirən Malayziyanın yaranmasına qarşı çıxmasından yaranan silahlı münaqişə idi.Münaqişə İndoneziyanın Hollandiya Yeni Qvineyaya qarşı əvvəlki qarşıdurmalarından və Bruney üsyanını dəstəkləməsindən qaynaqlanırdı.Malayziya Böyük Britaniya , Avstraliya və Yeni Zelandiyadan hərbi yardım alsa da, İndoneziya SSRİ və Çindən dolayı dəstək aldı və bu, Asiyada Soyuq Müharibənin bir fəslinə çevrildi.Münaqişənin əsas hissəsi İndoneziya ilə Şərqi Malayziya arasındakı Borneo sərhədində baş verib.Sıx cəngəllik ərazisi hər iki tərəfin geniş piyada patrulları aparmasına səbəb oldu, döyüş adətən kiçik miqyaslı əməliyyatları əhatə edirdi.İndoneziya Malayziyanı sarsıtmaq üçün Sabah və Saravakdakı etnik və dini müxtəliflikdən istifadə etməyə çalışdı.Hər iki xalq yüngül piyada və hava nəqliyyatına çox etibar edirdi, çaylar hərəkət və sızma üçün həlledici idi.İngilislər, Avstraliya və Yeni Zelandiya qüvvələrinin vaxtaşırı köməyi ilə birlikdə müdafiənin ən ağır yükünü çəkdilər.İndoneziyanın sızma taktikası zaman keçdikcə yerli könüllülərə güvənməkdən daha strukturlaşdırılmış İndoneziya hərbi birləşmələrinə keçərək inkişaf etdi.1964-cü ilə qədər İngilislər İndoneziya Kalimantanında Claret Əməliyyatı adlı gizli əməliyyatlara başladılar.Elə həmin il İndoneziya hücumlarını gücləndirdi, hətta Qərbi Malayziyanı da hədəfə aldı, lakin əhəmiyyətli uğur qazanmadı.İndoneziyanın 1965-ci il çevrilişindən sonra münaqişənin intensivliyi azaldı və bu çevriliş nəticəsində Sukarno general Suharto ilə əvəz olundu.Sülh danışıqları 1966-cı ildə başladı və 11 avqust 1966-cı ildə İndoneziyanın Malayziyanı rəsmi olaraq tanıdığı sülh sazişi ilə yekunlaşdı.