Kennedi administrasiyası Kuba hökumətinin devrilməsini gizli şəkildə asanlaşdırmağın müxtəlif yollarını sınaqdan keçirərək, Donuz körfəzinin işğalından sonra Kastronu devirmək yollarını axtarmağa davam etdi.1961-ci ildə Kennedi administrasiyası tərəfindən hazırlanmış terror hücumları və digər sabitliyi pozan əməliyyatlar proqramına böyük ümidlər bağlanmışdı. Xruşşov bu layihədən 1962-ci ilin fevralında xəbər tutdu və buna cavab olaraq Kubada Sovet nüvə raketlərinin quraşdırılmasına hazırlıq görüldü.Təşvişə düşən Kennedi müxtəlif reaksiyaları nəzərdən keçirdi.O, sonda Kubada nüvə raketlərinin quraşdırılmasına dəniz blokadası ilə cavab verdi və Sovet İttifaqına ultimatum təqdim etdi.Xruşşov qarşıdurmadan geri çəkildi və Sovet İttifaqı Amerikanın Kubanı bir daha işğal etməmək vədinə, habelə ABŞ raketlərini Türkiyədən çıxarmaq üçün gizli razılaşmaya müqabilində raketləri çıxardı.Kastro daha sonra etiraf etdi ki, “mən nüvə silahının istifadəsinə razı olardım... biz bunu hər halda nüvə müharibəsinə çevriləcəyini və yox olacağımızı təbii qəbul etmişdik”.Kuba Raket Böhranı (1962-ci ilin oktyabr-noyabr ayları) dünyanı əvvəlkindən daha çox nüvə müharibəsinə yaxınlaşdırdı.Soyuq Müharibənin ilk silahlara nəzarət müqaviləsi olan Antarktika Müqaviləsi 1961-ci ildə qüvvəyə minmiş olsa da, böhrandan sonra nüvə silahı yarışında nüvə silahsızlaşdırılması və münasibətlərin yaxşılaşdırılması istiqamətində ilk səylərə səbəb oldu.1964-cü ildə Xruşşovun Kremldəki həmkarları onu hakimiyyətdən uzaqlaşdıra bildilər, lakin ona sülh yolu ilə təqaüdə çıxmasına icazə verdilər.Kobudluq və səriştəsizlikdə ittiham olunan Con Lyuis Qaddis iddia edir ki, Xruşşov həm də Sovet kənd təsərrüfatını məhv etməkdə, dünyanı nüvə müharibəsi astanasına gətirməkdə və Xruşşovun Berlin divarının tikintisinə icazə verərkən “beynəlxalq biabırçılığa” çevrildiyini iddia edir.