In die vroeë 21ste eeu het Singapoer verskeie belangrike uitdagings gekonfronteer, veral die SAID-uitbraak in 2003 en die toenemende bedreiging van terrorisme.In 2001 is 'n kommerwekkende komplot wat ambassades en sleutelinfrastruktuur teiken, verydel, wat gelei het tot die arrestasie van 15 lede van die Jemaah Islamiyah.Hierdie voorval het die instelling van omvattende maatreëls teen terrorisme aangespoor wat gemik was op opsporing, voorkoming en skadevermindering.Terselfdertyd het die land se ekonomie relatief stabiel gebly, met die gemiddelde maandelikse huishoudelike inkomste in 2003 wat op SGD$4,870 gerapporteer is.In 2004 het Lee Hsien Loong, Lee Kuan Yew se oudste seun, na die posisie van Singapoer se derde eerste minister opgevaar.Onder sy leierskap is verskeie transformerende nasionale beleide voorgestel en geïmplementeer.Die duur van nasionale diensopleiding is veral verkort van twee en 'n half jaar na twee in 2005. Die regering het ook 'n "Cutting Red Tape"-program begin, wat aktief terugvoer van burgers oor 'n reeks kwessies soek, van wetlike raamwerke tot maatskaplike bekommernisse.Die algemene verkiesing van 2006 was 'n beduidende keerpunt in Singapoer se politieke landskap, hoofsaaklik as gevolg van die ongekende invloed van die internet en blog, wat ongereguleer deur die regering gebly het.In 'n strategiese stap net voor die verkiesing, het die regering 'n "vorderingspakket"-kontantbonus aan alle volwasse burgers uitgedeel, van altesaam SGD $2,6 miljard.Ten spyte van groot opkoms by opposisiebyeenkomste, het die regerende People's Action Party (PAP) sy vesting behou, 82 van die 84 setels verseker en 66% van die stemme gekry.Singapoer se post-onafhanklikheid verhouding met Maleisië was ingewikkeld, dikwels gekenmerk deur meningsverskille, maar tog onderstreep deur wedersydse vertroue.As lede van ASEAN erken beide nasies hul gedeelde streeksbelange.Hierdie interafhanklikheid word verder beklemtoon deur Singapoer se afhanklikheid van Maleisië vir 'n aansienlike deel van sy watervoorraad.Terwyl beide lande van tyd tot tyd verbale gesprekke het as gevolg van hul uiteenlopende bane na onafhanklikheid, het hulle gelukkig wegbeweeg van ernstige konflikte of vyandelikhede.