Nederlandse Malakka (1641–1825) was die langste tydperk wat Malakka onder buitelandse beheer was.Die Nederlanders het vir byna 183 jaar regeer met onderbroke Britse besetting tydens die Napoleontiese Oorloë (1795–1815).Hierdie era het relatiewe vrede beleef met min ernstige onderbreking van die Maleise sultanate as gevolg van die verstandhouding wat in 1606 tussen die Nederlanders en die Sultanaat van Johor gesmee is. Hierdie tyd het ook die afname in die belangrikheid van Malakka gekenmerk.Die Nederlanders het Batavia (hedendaagse Djakarta) verkies as hul ekonomiese en administratiewe sentrum in die streek en hul houvas in Malakka was om die verlies van die stad aan ander Europese moondhede en, gevolglik, die mededinging wat daarmee sou saamgaan, te voorkom.Dus, in die 17de eeu, met Malakka wat opgehou het om 'n belangrike hawe te wees, het die Johor Sultanaat die dominante plaaslike moondheid in die streek geword as gevolg van die opening van sy hawens en die alliansie met die Nederlanders.