In 1241–1242 het die koninkryk 'n groot knou gekry in die nasleep van die Mongoolse inval in Europa.Nadat Hongarye in 1241 deur die Mongole binnegeval is, is die Hongaarse leër in die Slag van Mohi rampspoedig verslaan.Koning Béla IV het van die slagveld gevlug en toe die land nadat die Mongole hom tot by sy grense agtervolg het.Voordat die Mongole teruggetrek het, het 'n groot deel van die bevolking (20-50%) gesterf.^[22] In die vlaktes is tussen 50 en 80% van die nedersettings vernietig.^[23] Slegs kastele, sterk versterkte stede en abdye kon die aanval weerstaan, aangesien die Mongole nie tyd gehad het vir lang beleërings nie – hulle doel was om so gou moontlik weswaarts te trek.Die belegmotors en dieChinese en Persiese ingenieurs wat dit vir die Mongole bedryf het, is in die verowerde lande van Kyivan-Roes gelaat.^[24] Die verwoesting wat deur die Mongoolse invalle veroorsaak is, het later gelei tot die uitnodiging van setlaars uit ander dele van Europa, veral uit Duitsland.Tydens die Mongole se veldtog teen Kiëf-Roes is sowat 40 000 Cumans , lede van 'n nomadiese stam van heidense Kipchaks, wes van die Karpate-berge verdryf.^[25] Daar het die Cumans 'n beroep op koning Béla IV gedoen vir beskerming.^[26] Die Iranse Jassiese mense het saam met die Cumans na Hongarye gekom nadat hulle deur die Mongole verslaan is.Cumans het miskien tot 7–8% van die bevolking van Hongarye in die tweede helfte van die 13de eeu uitgemaak.^[27] Deur die eeue is hulle ten volle geassimileer in die Hongaarse bevolking, en hul taal het verdwyn, maar hulle het hul identiteit en hul streeksoutonomie tot 1876 bewaar. ^[28]As gevolg van die Mongoolse invalle het koning Béla die bou van honderde klipkastele en fortifikasies beveel om te help verdedig teen 'n moontlike tweede Mongoolse inval.Die Mongole het inderdaad in 1286 na Hongarye teruggekeer, maar die nuutgeboude klipkasteelstelsels en nuwe militêre taktiek wat 'n groter persentasie swaargewapende ridders betrek het, het hulle gekeer.Die invallende Mongoolse mag is naby Pest deur die koninklike leër van koning Ladislaus IV verslaan.Latere invalle is ook handig afgeweer.Die kastele wat deur Béla IV gebou is, was later baie nuttig in die lang stryd teen die Ottomaanse Ryk .Die koste van die bou daarvan het egter die Hongaarse koning verskuldig aan die groot feodale grondeienaars gehad, sodat die koninklike mag wat deur Béla IV teruggeëis is nadat sy vader Andrew II dit aansienlik verswak het, weer eens onder die mindere adelstand versprei is.