У 1958 році парламентська система Пакистану покінчила з введенням воєнного стану.Суспільне розчарування корупцією в цивільній бюрократії та адміністрації призвело до підтримки дій генерала Аюб Хана.^[16] Військовий уряд провів значні земельні реформи та ввів у дію Наказ про дискваліфікацію виборних органів, заборонивши Г. С. Сухраварді займати державні посади.Хан запровадив «базову демократію», нову президентську систему, за якої колегія виборців із 80 000 осіб обирала президента, і проголосив конституцію 1962 року.^[17] У 1960 році Аюб Хан отримав підтримку населення на національному референдумі, перейшовши від військового до конституційного цивільного уряду.^[16]Значні події під час президентства Аюб Хана включали перенесення інфраструктури столиці з Карачі до Ісламабаду.Ця епоха, відома як «Велике десятиліття», відзначається своїм економічним розвитком і культурними зрушеннями ^[18] , включаючи піднесення індустрії поп-музики, кіно та драматургії.Аюб Хан приєднав Пакистан до Сполучених Штатів і західного світу, приєднавшись до Організації Центрального договору (CENTO) і Організації Договору Південно-Східної Азії (SEATO).Приватний сектор зростав, і країна досягла успіхів у сфері освіти, людського розвитку та науки, включаючи запуск космічної програми та продовження ядерно-енергетичної програми.^[18]Однак інцидент із літаком-розвідником U2 у 1960 році викрив секретні операції США з Пакистану, поставивши під загрозу національну безпеку.Того ж року Пакистан підписав з Індією Договір про води Інду для нормалізації відносин.^[19] Відносини з Китаєм зміцнилися, особливо після китайсько-індійської війни, що призвело до угоди про кордон у 1963 році, яка змінила динаміку холодної війни .У 1964 році збройні сили Пакистану придушили ймовірне прокомуністичне повстання в Західному Пакистані, а в 1965 році Аюб Хан з незначною перевагою переміг на суперечливих президентських виборах проти Фатіми Джинни.