Султанат Перак був заснований на початку 16 століття на берегах річки Перак Музаффар-шахом I, старшим сином Махмуд-шаха, 8-го султана Малакки.Після захоплення Малакки португальцями в 1511 році Музаффар-шах шукав притулку в Сіаку на Суматрі, перш ніж зійти на престол у Пераку.Його створенню султанату Перак сприяли місцеві лідери, включаючи Тун Сабана.За нового султанату адміністрація Перака стала більш організованою, спираючись на феодальну систему, яка практикувалася в демократичній Малакці.У 16 столітті Перак став важливим джерелом олов’яної руди, залучаючи регіональних і міжнародних торговців.Однак зростання султанату привернуло увагу могутнього султанату Ачех , що призвело до періоду напруженості та взаємодії.Протягом 1570-х років Ачех наполегливо переслідував частини Малайського півострова.Наприкінці 1570-х років вплив Ачеха став очевидним, коли султан Перака Мансур Шах I таємниче зник, що підживило припущення про його викрадення силами Ачену.Це призвело до того, що родина султана потрапила в полон на Суматру.У результаті Перак ненадовго перебував під владою Ачену, коли аченський принц зійшов на трон Перака як Султан Ахмад Таджуддін Шах.Проте, незважаючи на вплив Ачеха, Перак залишався автономним, опираючись контролю як з боку ачехів, так і сіамців.Контроль Ачеха над Пераком почав слабшати з приходом голландської Ост-Індської компанії (VOC) у середині 17 століття.Ачех і VOC змагалися за контроль над прибутковою торгівлею Перака оловом.До 1653 року вони досягли компромісу, підписавши договір, який надав голландцям виключні права на олово Перака.Наприкінці 17 століття, із занепадом Джохорського султанату, Перак став останнім спадкоємцем малакканської лінії, але зіткнувся з внутрішніми чварами, включаючи 40-річну громадянську війну у 18 столітті через доходи від олова.Кульмінацією цих заворушень став договір 1747 року з голландцями, який визнав їхню монополію на торгівлю оловом.