Між 1258 і 1291 роками регіон зіткнувся з потрясіннями як кордон між монгольськими загарбниками , іноді в союзі з хрестоносцями , імамлюкамиЄгипту .Цей конфлікт призвів до значного скорочення населення та економічних труднощів.Мамлюки були переважно турецького походження, їх купували в дитинстві, а потім навчали воювати.Вони були високо цінованими воїнами, які давали правителям незалежність від місцевої аристократії.У Єгипті вони взяли під свій контроль королівство після невдалого вторгнення хрестоносців (Сьомий хрестовий похід).Мамлюки захопили контроль над Єгиптом і поширили свою владу на Палестину.Перший мамлюкский султан, Кутуз, переміг монголів у битві при Айн-Джалуті, але був убитий Байбарсом, який змінив його та знищив більшість форпостів хрестоносців.Мамлюки правили Палестиною до 1516 року, вважаючи її частиною Сирії.У Хевроні євреї зіткнулися з обмеженнями в Печері патріархів, значущому місці в іудаїзмі, обмеженням, яке тривало до Шестиденної війни.^[146]Аль-Ашраф Халіл, мамлюкский султан, захопив останню фортецю хрестоносців у 1291 році. Мамлюки, продовжуючи політику Айюбідів, стратегічно знищили прибережні регіони від Тіру до Гази, щоб запобігти потенційним нападам хрестоносців з моря.Це спустошення призвело до тривалої депопуляції та економічного занепаду в цих районах.^[147]Єврейська громада в Палестині побачила омолодження з припливом євреїв-сефардів після їхнього вигнання зІспанії в 1492 році та переслідування в Португалії в 1497 році. Під правлінням мамлюків, а згодом і Османської імперії, ці євреї-сефарди переважно оселялися в міських районах, таких як Цфат і Єрусалим, на відміну від переважно сільська єврейська громада Мустаарбі.^[148]