Sa Anatolia sa praktikal na anarkiya at ang hukbong Ottoman ay kaduda-dudang tapat bilang reaksyon sa mga Allied land seizure, itinatag ni Mehmed VI ang military inspectorate system upang muling itatag ang awtoridad sa natitirang imperyo.Hinikayat nina Karabekir at Edmund Allenby, itinalaga niya si Mustafa Kemal Pasha (Atatürk) bilang inspektor ng Ninth Army Troops Inspectorate –na nakabase sa Erzurum– upang ibalik ang kaayusan sa mga yunit ng militar ng Ottoman at upang mapabuti ang panloob na seguridad noong 30 Abril 1919. Si Mustafa Kemal ay isang kilala, iginagalang, at konektadong kumander ng hukbo, na may malaking prestihiyo na nagmumula sa kanyang katayuan bilang "Bayani ng Anafartalar"—para sa kanyang tungkulin sa Kampanya sa Gallipoli —at ang kanyang titulong "Honorary Aide-de-camp sa Kanyang Kamahalan na Sultan " nakuha sa mga huling buwan ng Unang Digmaang Pandaigdig .Siya ay isang nasyonalista at isang mabangis na kritiko ng patakaran ng pamahalaan na matulungin sa mga kapangyarihan ng Entente.Kahit na siya ay isang miyembro ng CUP, siya ay madalas na nakikipagsagupaan sa Komite Sentral sa panahon ng digmaan at samakatuwid ay na-sideline sa paligid ng kapangyarihan, ibig sabihin siya ang pinaka-lehitimong nasyonalista para sa Mehmed VI upang patahimikin.Sa bagong klimang pampulitika na ito, hinangad niyang samantalahin ang kanyang mga pagsasamantala sa digmaan para makakuha ng mas magandang trabaho, sa katunayan, ilang beses siyang hindi matagumpay na nag-lobby para sa kanyang pagsasama sa gabinete bilang War Minister.Ang kanyang bagong atas ay nagbigay sa kanya ng mabisang kapangyarihang plenipotentiary sa buong Anatolia na nilayon upang mapaunlakan siya at iba pang nasyonalista upang mapanatili silang tapat sa gobyerno.Nauna nang tumanggi si Mustafa Kemal na maging pinuno ng Sixth Army na naka-headquarter sa Nusaybin.Ngunit ayon kay Patrick Balfour, sa pamamagitan ng pagmamanipula at tulong ng mga kaibigan at mga nakikiramay, siya ay naging inspektor ng halos lahat ng pwersa ng Ottoman sa Anatolia, na inatasan sa pangangasiwa sa proseso ng disbanding ng mga natitirang pwersang Ottoman.Si Kemal ay may maraming koneksyon at mga personal na kaibigan na nakatuon sa post-armistice Ottoman War Ministry, isang makapangyarihang kasangkapan na tutulong sa kanya na maisakatuparan ang kanyang lihim na layunin: ang pamunuan ang isang nasyonalistang kilusan laban sa Allied powers at isang collaborative na pamahalaang Ottoman.Isang araw bago ang kanyang pag-alis sa Samsun sa liblib na baybayin ng Black Sea, nagkaroon si Kemal ng isang huling madla kasama si Mehmed VI.Ipinangako niya ang kanyang katapatan sa sultan-caliph at ipinaalam din sa kanila ang pananakop ng mga Griyego sa Smyrna (İzmir).Siya at ang kanyang maingat na piniling mga tauhan ay umalis sa Constantinople sakay ng lumang bapor na SS Bandırma noong gabi ng 16 Mayo 1919.