Sinakop ng mga Burmese , sa pamumuno ni King Bayinnaung, ang Chiang Mai, na nagpasimula ng 200-taong pamamahala ng Burmese sa Lan Na.Ang salungatan ay lumitaw sa mga estado ng Shan, kung saan ang ekspansyonistang ambisyon ng Bayinnaung ay humantong sa isang pagsalakay sa Lan Na mula sa hilaga.Noong 1558, si Mekuti, ang pinuno ng Lan Na, ay sumuko sa Burmese noong 2 Abril 1558. ^[17]Sa panahon ng Digmaang Burmese– Siamese (1563–64), nag-alsa si Mekuti nang may paghihikayat mula kay Setthathirath.Gayunpaman, nahuli siya ng mga pwersang Burmese noong 1564 at dinala sa Pegu, pagkatapos ay ang kabisera ng Burmese.Hinirang ni Bayinnaung si Wisutthithewi, isang Lan Na royal, bilang reyna na naghahari sa Lan Na pagkamatay ni Mekuti.Nang maglaon, noong 1579, isa sa mga anak ni Bayinnaung, si Nawrahta Minsaw, ^[18] ang naging viceroy ng Lan Na.Habang tinatamasa ni Lan Na ang ilang awtonomiya, mahigpit na kinokontrol ng Burmese ang paggawa at pagbubuwis.Kasunod ng panahon ni Bayinnaung, nawasak ang kanyang imperyo.Matagumpay na nag-alsa ang Siam (1584–93), na humantong sa pagkawasak ng mga basalyo ni Pegu noong 1596–1597.Ang Lan Na, sa ilalim ng Nawrahta Minsaw, ay nagdeklara ng kalayaan noong 1596 at saglit na naging tributary ng Haring Naresuan ng Siam noong 1602. Gayunpaman, ang awtoridad ng Siam ay humina pagkatapos ng kamatayan ni Naresuan noong 1605, at noong 1614, mayroon itong nominal na kontrol sa Lan Na.Humingi ng tulong si Lan Na kay Lan Xang kaysa sa Siam nang bumalik ang Burmese.^[19] Sa loob ng mahigit isang siglo pagkatapos ng 1614, pinamunuan ng mga basalyong hari na may lahing Burmese ang Lan Na, sa kabila ng pagtatangka ni Siam na igiit ang kontrol noong 1662–1664, na sa huli ay nabigo.