Nagmartsa si Louis patungong Naples noong Pebrero.Inalok siya ng mga mamamayan ng isang seremonyal na pagpasok, ngunit tumanggi siya, nagbanta na hahayaan niyang sirain ng kanyang mga sundalo ang bayan kung hindi nila itataas ang buwis.Pinagtibay niya ang mga tradisyunal na titulo ng mga hari ng Naples – "Hari ng Sicily at Jerusalem, Duke ng Apulia at Prinsipe ng Capua" - at pinangasiwaan ang kaharian mula sa Castel Nuovo, na nag-garrison sa kanyang mga mersenaryo sa pinakamahahalagang kuta.Gumamit siya ng hindi pangkaraniwang brutal na paraan ng pagsisiyasat upang mahuli ang lahat ng mga kasabwat sa pagkamatay ng kanyang kapatid, ayon kay Domenico da Gravina.Karamihan sa mga lokal na maharlikang pamilya (kabilang ang mga Balzo at ang Sanseverino) ay tumanggi na makipagtulungan sa kanya.Tumanggi ang papa na kumpirmahin ang pamumuno ni Louis sa Naples, na magbubuklod sa dalawang makapangyarihang kaharian sa ilalim ng pamamahala ni Louis.Idineklara ng papa at ng mga cardinals na inosente si Reyna Joanna sa pagpatay sa kanyang asawa sa isang pormal na pagpupulong ng College of Cardinals.