Sa pangkalahatang halalan noong 1990, nakakuha ng sapat na suporta ang konserbatibong alyansa ng kanang pakpak, ang Islamic Democratic Alliance (IDA) na pinamumunuan ni Nawaz Sharif, upang bumuo ng isang pamahalaan.Ito ay minarkahan ang unang pagkakataon na ang isang konserbatibong alyansa ng kanang pakpak ay kumuha ng kapangyarihan sa ilalim ng isang demokratikong sistema sa Pakistan.Nakatuon ang administrasyon ni Sharif sa pagtugon sa stagflation ng bansa sa pamamagitan ng pagpapatupad ng mga patakaran ng pribatisasyon at liberalisasyon ng ekonomiya.Bukod pa rito, pinanatili ng kanyang pamahalaan ang isang patakaran ng kalabuan hinggil sa mga programa ng bomba atomika ng Pakistan.Sa panahon ng kanyang panunungkulan, sinali ni Sharif ang Pakistan sa Gulf War noong 1991 at nagpasimula ng operasyong militar laban sa mga liberal na pwersa sa Karachi noong 1992. Gayunpaman, ang kanyang pamahalaan ay nahaharap sa mga hamon sa institusyon, partikular kay Pangulong Ghulam Khan.Tinangka ni Khan na bale-walain si Sharif gamit ang mga katulad na kaso na dati niyang inihain laban kay Benazir Bhutto.Noong una ay napatalsik si Sharif ngunit naibalik sa kapangyarihan kasunod ng paghatol ng Korte Suprema.Sa isang pampulitikang maniobra, nagtulungan sina Sharif at Bhutto para tanggalin si Pangulong Khan sa pwesto.Sa kabila nito, panandalian lang ang termino ni Sharif, dahil sa huli ay napilitan siyang bumaba sa puwesto dahil sa panggigipit ng pamunuan ng militar.