Noong 332 BCE, sinakop ni Alexander the Great ng Macedon ang rehiyon bilang bahagi ng kanyang kampanya laban sa Imperyong Persia .Pagkatapos ng kanyang kamatayan noong 322 BCE, hinati ng kanyang mga heneral ang imperyo at ang Judea ay naging hangganan na rehiyon sa pagitan ng Seleucid Empire at Ptolemaic Kingdom saEgypt .Kasunod ng isang siglo ng pamamahala ni Ptolemaic, ang Judea ay nasakop ng Seleucid Empire noong 200 BCE sa labanan sa Panium.Karaniwang iginagalang ng mga pinunong Helenistiko ang kulturang Judio at pinoprotektahan ang mga institusyong Judio.^[88] Ang Judea ay pinamumunuan ng namamanang katungkulan ng Mataas na Saserdote ng Israel bilang isang Hellenistic na basalyo.Gayunpaman, ang rehiyon ay sumailalim sa proseso ng Hellenization, na nagpapataas ng tensyon sa pagitan ng mga Griyego , Helenisadong Hudyo, at mapagmasid na Hudyo.Ang mga tensyon na ito ay lumaki sa mga sagupaan na kinasasangkutan ng isang pakikibaka sa kapangyarihan para sa posisyon ng mataas na saserdote at ang katangian ng banal na lungsod ng Jerusalem.^[89]Nang italaga ni Antiochus IV Epiphanes ang templo, ipinagbawal ang mga gawaing Judio, at pilit na ipinataw ang mga pamantayang Helenistiko sa mga Judio, natapos ang ilang siglo ng pagpaparaya sa relihiyon sa ilalim ng kontrol ng Helenistiko.Noong 167 BCE, sumiklab ang pag-aalsa ng Maccabean matapos na si Mattathias, isang Judiong pari ng angkan ng Hasmonean, ay pumatay ng isang Hellenized na Hudyo at isang opisyal ng Seleucid na lumahok sa paghahain sa mga diyos ng Griyego sa Modi'in.Natalo ng kaniyang anak na si Judas Maccabeus ang mga Seleucid sa ilang labanan, at noong 164 BCE, nabihag niya ang Jerusalem at ibinalik ang pagsamba sa templo, isang pangyayaring ginunita ng Jewish festival ng Hannukah.^[90]Pagkamatay ni Judas, ang kanyang mga kapatid na sina Jonathan Apphus at Simon Thassi ay nakapagtatag at nakapag-iisa ng isang basal na estado ng Hasmonean sa Judea, na sinamantala ang pagbagsak ng Seleucid Empire bilang resulta ng panloob na kawalang-tatag at mga digmaan sa mga Parthia, at sa pamamagitan ng pakikipag-ugnayan sa sumisikat na Republika ng Roma.Ang pinuno ng Hasmonean na si John Hyrcanus ay nakakuha ng kalayaan, na nagdoble sa mga teritoryo ng Judea.Kinuha niya ang kontrol sa Idumaea, kung saan na-convert niya ang mga Edomita sa Hudaismo, at sinalakay ang Scythopolis at Samaria, kung saan giniba niya ang Templo ng Samaritano.^[91] Si Hyrcanus din ang unang pinuno ng Hasmonean na gumawa ng mga barya.Sa ilalim ng kaniyang mga anak, sina haring Aristobulus I at Alexander Jannaeus, ang Hasmonean Judea ay naging isang kaharian, at ang mga teritoryo nito ay patuloy na lumawak, na ngayon ay sumasaklaw din sa baybaying kapatagan, Galilea at mga bahagi ng Transjordan.^[92]Sa ilalim ng pamamahala ng Hasmonean, ang mga Pariseo, Saduseo at ang mistikong Essenes ay lumitaw bilang pangunahing kilusang panlipunan ng mga Hudyo.Ang Pariseong pantas na si Simeon ben Shetach ay pinarangalan sa pagtatatag ng mga unang paaralan na nakabase sa paligid ng mga bahay-pulungan.^[93] Ito ay isang mahalagang hakbang sa paglitaw ng Rabbinical Judaism.Pagkaraang mamatay ang balo ni Jannaeus, ang reyna na si Salome Alexandra, noong 67 BCE, ang kanyang mga anak na sina Hyrcanus II at Aristobulus II ay sumabak sa isang digmaang sibil nang magkakasunod.Ang mga magkasalungat na partido ay humiling ng tulong ni Pompey para sa kanila, na naging daan para sa pagkuha ng Romano sa kaharian.^[94]