Noong Enero 1863, ang Hukbo ng Potomac, kasunod ng Labanan sa Fredericksburg at ang nakakahiyang Mud March, ay dumanas ng tumataas na desersyon at bumubulusok na moral.Sinubukan ni Lincoln sa ikalimang pagkakataon sa isang bagong heneral noong Enero 25, 1863—si Maj.Gen. Joseph Hooker, isang lalaking may masungit na reputasyon na mahusay na gumanap sa mga nakaraang subordinate command.^[56]Sinimulan ni Hooker ang isang kailangang-kailangan na reorganisasyon ng hukbo, na tinatanggal ang sistema ng grand division ng Burnside, na napatunayang mahirap gamitin;wala na rin siyang sapat na matataas na opisyal sa kamay na mapagkakatiwalaan niyang mag-utos ng multi-corps operations.^[57] Inorganisa niya ang mga kabalyero sa isang hiwalay na pulutong sa ilalim ng pamumuno ni Brig.Heneral George Stoneman.Ngunit habang itinutuon niya ang mga kabalyerya sa isang organisasyon, ikinalat niya ang kanyang mga batalyon ng artilerya sa kontrol ng mga commander ng infantry division, na inalis ang koordinasyong impluwensya ng punong artilerya ng hukbo, si Brig.Gen. Henry J. Hunt.Kabilang sa kanyang mga pagbabago ay ang mga pag-aayos sa pang-araw-araw na diyeta ng mga tropa, mga pagbabago sa sanitary ng kampo, mga pagpapabuti at pananagutan ng sistema ng quartermaster, pagdaragdag at pagsubaybay sa mga tagapagluto ng kumpanya, ilang mga reporma sa ospital, isang pinabuting sistema ng furlough, mga utos na pigilan ang tumataas na desertion, pinabuting mga pagsasanay. , at mas malakas na pagsasanay sa opisyal.Ang dalawang hukbo ay nagharap laban sa isa't isa sa Fredericksburg noong taglamig ng 1862–1863.Nagsimula ang kampanya ng Chancellorsville nang palihim na inilipat ni Hooker ang karamihan ng kanyang hukbo sa kaliwang pampang ng Rappahannock River, pagkatapos ay tumawid ito noong umaga ng Abril 27, 1863. Ang mga kabalyerya ng unyon sa ilalim ni Maj. Gen. George Stoneman ay nagsimula ng isang malayuang pagsalakay laban sa Ang mga linya ng supply ni Lee sa halos parehong oras.Sa pagtawid sa Rapidan River sa pamamagitan ng Germanna at Ely's Fords, ang Federal infantry ay tumutok malapit sa Chancellorsville noong Abril 30. Kasama ng puwersa ng Unyon na nakaharap sa Fredericksburg, nagplano si Hooker ng double envelopment, na sinasalakay si Lee mula sa kanyang harapan at likuran.Noong Mayo 1, si Hooker ay sumulong mula sa Chancellorsville patungo sa Lee, ngunit hinati ng Confederate general ang kanyang hukbo sa harap ng mas mataas na bilang, na nag-iwan ng isang maliit na puwersa sa Fredericksburg upang hadlangan si Maj. Gen. John Sedgwick mula sa pagsulong, habang inatake niya ang pagsulong ni Hooker na may halos apat. -ikalima ng kanyang hukbo.Sa kabila ng mga pagtutol ng kanyang mga subordinates, inalis ni Hooker ang kanyang mga tauhan sa mga depensibong linya sa paligid ng Chancellorsville, na isinuko ang inisyatiba kay Lee.Noong Mayo 2, hinati muli ni Lee ang kanyang hukbo, na ipinadala ang buong corps ni Stonewall Jackson sa isang flanking martsa na nagruta sa Union XI Corps.Ang pinakamabangis na labanan sa labanan—at ang pangalawang pinakamadugong araw ng Digmaang Sibil—ay naganap noong Mayo 3 nang si Lee ay naglunsad ng maraming pag-atake laban sa posisyon ng Unyon sa Chancellorsville, na nagresulta sa matinding pagkatalo sa magkabilang panig at ang paghila pabalik ng pangunahing hukbo ni Hooker.Noong araw ding iyon, sumulong si Sedgwick sa Rappahannock River, tinalo ang maliit na puwersa ng Confederate sa Marye's Heights sa Ikalawang Labanan ng Fredericksburg, at pagkatapos ay lumipat sa kanluran.Ang Confederates ay nakipaglaban sa isang matagumpay na pag-antala ng aksyon sa Battle of Salem Church.Sa ika-4 na si Lee ay tumalikod kay Hooker at inatake si Sedgwick, at ibinalik siya sa Ford ng Banks, pinalibutan sila sa tatlong panig.Si Sedgwick ay umatras sa tawid nang maaga noong Mayo 5. Si Lee ay bumalik upang harapin si Hooker na nag-withdraw sa natitirang bahagi ng kanyang hukbo sa US Ford noong gabi ng Mayo 5–6.Ang Chancellorsville ay kilala bilang "perpektong labanan" ni Lee ^[58] dahil ang kanyang mapanganib na desisyon na hatiin ang kanyang hukbo sa presensya ng isang mas malaking puwersa ng kaaway ay nagresulta sa isang makabuluhang tagumpay ng Confederate.Ang tagumpay, isang produkto ng kapangahasan ni Lee at ang mahiyain na pagdedesisyon ni Hooker, ay binago ng mabibigat na kaswalti, kabilang si Lt. Gen. Thomas J. "Stonewall" Jackson.Tinamaan si Jackson ng friendly fire, na nangangailangan ng kanyang kaliwang braso na putulin.Namatay siya sa pneumonia pagkalipas ng walong araw, isang pagkawala na inihalintulad ni Lee sa pagkawala ng kanyang kanang braso.