Mnamo Machi 2020, huku kukiwa na msukosuko wa kisiasa, Muhyiddin Yassin aliteuliwa kuwa Waziri Mkuu wa nane wa Malaysia kufuatia Mahathir Mohamad kujiuzulu ghafla.Aliongoza serikali mpya ya muungano ya Perikatan Nasional.Muda mfupi baada ya kuchukua madaraka, janga la COVID-19 liliikumba Malaysia, na kumfanya Muhyiddin kutekeleza agizo la kudhibiti harakati za Malaysia (MCO) mnamo Machi 2020 ili kuzuia kuenea kwake.Kipindi hiki pia kilishuhudia Waziri Mkuu wa zamani Najib Razak akitiwa hatiani kwa tuhuma za ufisadi mnamo Julai 2020, ikiwa ni mara ya kwanza kwa Waziri Mkuu wa Malaysia kukabiliwa na hatia kama hiyo.Mwaka wa 2021 ulileta changamoto zaidi kwa utawala wa Muhyiddin.Mnamo Januari, Yang di-Pertuan Agong ilitangaza hali ya hatari ya kitaifa, kusimamisha vikao vya bunge na uchaguzi, na kuruhusu serikali kutunga sheria bila idhini ya kisheria kwa sababu ya janga linaloendelea na ukosefu wa utulivu wa kisiasa.Licha ya changamoto hizi, serikali ilizindua mpango wa kitaifa wa chanjo ya COVID-19 mnamo Februari.Hata hivyo, mwezi Machi, uhusiano wa kidiplomasia kati ya Malaysia na Korea Kaskazini ulikatizwa baada ya rufaa ya mfanyabiashara wa Korea Kaskazini kurejea Marekani kukataliwa na Mahakama Kuu ya Kuala Lumpur.Kufikia Agosti 2021, mizozo ya kisiasa na kiafya iliongezeka, huku Muhyiddin akikabiliwa na ukosoaji mkubwa kwa jinsi serikali inavyoshughulikia janga hili na kuzorota kwa uchumi.Hii ilisababisha apoteze uungwaji mkono wa wengi bungeni.Kwa hiyo, Muhyiddin alijiuzulu kama Waziri Mkuu mnamo Agosti 16, 2021. Kufuatia kujiuzulu, aliteuliwa kuwa Waziri Mkuu wa muda na Yang di-Pertuan Agong hadi mrithi anayefaa atakapochaguliwa.