Kati ya 1258 na 1291, eneo hilo lilikabiliwa na msukosuko kama mpaka kati ya wavamizi wa Mongol , mara kwa mara wakishirikiana na Wanajeshi wa Msalaba , naWamamluki waMisri .Mgogoro huu ulisababisha kupungua kwa idadi ya watu na matatizo ya kiuchumi.Wamamluk wengi wao walikuwa na asili ya Kituruki, na walinunuliwa wakiwa watoto na kisha wakafunzwa vita.Walikuwa wapiganaji waliothaminiwa sana, ambao waliwapa watawala uhuru wa wenyeji wa aristocracy.Huko Misri walichukua udhibiti wa ufalme kufuatia uvamizi usiofanikiwa wa Wanajeshi wa Msalaba (Krusadi ya Saba).Wamamluk walichukua udhibiti huko Misri na kupanua utawala wao hadi Palestina.Mamluk Sultani wa kwanza, Qutuz, aliwashinda Wamongolia kwenye Vita vya Ain Jalut, lakini aliuawa na Baibars, ambao walimfuata na kuangamiza vituo vingi vya Crusader.Wamamluk walitawala Palestina hadi 1516, wakiichukulia kama sehemu ya Syria.Huko Hebroni, Wayahudi walikabiliwa na vizuizi kwenye Pango la Mababu, eneo muhimu katika Dini ya Kiyahudi, kizuizi ambacho kiliendelea hadi Vita vya Siku Sita.^[146]Al-Ashraf Khalil, sultani wa Mamluk, aliteka ngome ya mwisho ya Vita vya Msalaba mwaka 1291. Wamamluk, wakiendelea na sera za Ayyubid, waliharibu kimkakati maeneo ya pwani kutoka Tiro hadi Gaza ili kuzuia mashambulizi ya baharini ya Crusader.Uharibifu huu ulisababisha kupungua kwa watu kwa muda mrefu na kushuka kwa uchumi katika maeneo haya.^[147]Jumuiya ya Kiyahudi huko Palestina iliona kufufuka kwa utitiri wa Wayahudi wa Sephardic kufuatia kufukuzwa kwao kutokaUhispania mnamo 1492 na mateso huko Ureno mnamo 1497. Chini ya utawala wa Mamluk na baadaye Ottoman , Wayahudi hawa wa Sephardic walikaa katika maeneo ya mijini kama Safed na Jerusalem, tofauti na hasa jamii ya Wayahudi ya Musta'arbi ya vijijini.^[148]