Mwishoni mwa karne ya 11, nasaba ya Khwarazmian ilichukua udhibiti wa Iraq.Kipindi hiki cha utawala wa kilimwengu wa Kituruki na ukhalifa wa Abbas ulihitimishwa na uvamizi wa Wamongolia katika karne ya 13.^[51] Wamongolia, wakiongozwa na Genghis Khan, walikuwa wameiteka Khwarezmia kufikia mwaka wa 1221. Hata hivyo, Iraki ilipata ahueni ya muda kutokana na kifo cha Genghis Khan mwaka wa 1227 na baadae mapambano ya mamlaka ndani ya Milki ya Mongol.Möngke Khan, kutoka 1251, alitawala upanuzi wa Mongol, na wakati Khalifa al-Mustasim alikataa madai ya Mongol, Baghdad ilikabiliwa na kuzingirwa na Hulagu Khan mwaka wa 1258.Kuzingirwa kwa Baghdad, tukio muhimu katika ushindi wa Wamongolia, lilichukua muda wa siku 13 kutoka Januari 29 hadi 10 Februari 1258. Majeshi ya Mongol ya Ilkhanate , pamoja na washirika wao, walizingira, waliteka, na hatimaye kuifuta Baghdad, mji mkuu wa Ukhalifa wa Abbasid wakati huo. .Kuzingirwa huko kulitokeza mauaji ya wakaaji wengi wa jiji hilo, ambayo huenda yakafikia mamia ya maelfu.Kiwango cha uharibifu wa maktaba za jiji na yaliyomo yake muhimu bado ni mada ya mjadala kati ya wanahistoria.Vikosi vya Mongol vilimuua Al-Musta'sim na kusababisha uharibifu mkubwa wa watu na uharibifu kwa Baghdad.Kuzingirwa huku kuliashiria mwisho wa Enzi ya Dhahabu ya Kiislamu, kipindi ambacho makhalifa walikuwa wamepanua utawala wao kutoka Rasi ya Iberia hadi Sindh.