Ivan Ivanovichs förhållande till sin far började försämras under de senare stadierna av det livländska kriget.Ivan var arg på sin far för hans militära misslyckanden och krävde att få kommandot över några trupper för att befria den belägrade Pskov.Deras förhållande försämrades ytterligare när tsaren den 15 november 1581, efter att ha sett sin gravida svärdotter iklädd okonventionellt lätta kläder, överföll henne fysiskt.I ett anfall av vrede mördade Ivan sin äldste son och arvtagare, Ivan Ivanovich, och den senares ofödda barn, vilket lämnade hans yngre son, den politiskt ineffektive Feodor Ivanovich, att ärva tronen, en man vars styre direkt ledde till slutet av Rurikiddynastin och början av oroligheternas tid.