1965 förklarade Pakistans utrikesminister Zulfikar Ali Bhutto vid FN:s generalförsamling och med atomforskaren Aziz Ahmed närvarande Pakistans beslutsamhet att utveckla en kärnvapenkapacitet om Indien gjorde det, även till stora ekonomiska kostnader.Detta ledde till utökad kärnkraftsinfrastruktur med internationella samarbeten.Men Bhuttos oenighet med Tasjkentavtalet 1966 ledde till att han avsattes av president Ayub Khan, vilket utlöste offentliga massdemonstrationer och strejker.Ayub Khans "Decennium av utveckling" 1968 mötte motstånd, med vänsterstudenter som kallade det "decennium av dekadens" ^{[, 20]} och kritiserade hans politik för att främja kumpankapitalism och etniskt-nationalistiskt förtryck. Ekonomiska skillnader mellan västra och östra Pakistan underblåste den bengaliska nationalismen , med Awami-ligan, ledd av Sheikh Mujibur Rahman, som krävde autonomi. Socialismens framväxt och Pakistans folkparti (PPP), grundat av Bhutto, utmanade Khans regim ytterligare.1967 kapitaliserade PPP på allmänhetens missnöje och ledde till stora strejker för arbetarna.Trots förtryck uppstod en utbredd rörelse 1968, vilket försvagade Khans position;det är känt som 1968-rörelsen i Pakistan.^[21] Agartala-fallet, som involverade arrestering av Awami League-ledare, drogs tillbaka efter uppror i östra Pakistan.Med påtryckningar från PPP, offentlig oro och sjunkande hälsa avgick Khan 1969 och överlämnade makten till general Yahya Khan, som sedan införde krigslagar.