Under Bosnienkriget 1991–1995 och det kroatiska kriget deltog Montenegro med sina polis- och militärstyrkor i attackerna mot Dubrovnik, Kroatien och bosniska städer tillsammans med serbiska trupper, aggressiva handlingar som syftade till att skaffa fler territorier med våld, kännetecknade av ett konsekvent mönster av grova och systematiska kränkningar av mänskliga rättigheter.Den montenegrinske generalen Pavle Strugar har sedan dess dömts för sin del i bombningen av Dubrovnik.Bosniska flyktingar arresterades av montenegrinsk polis och transporterades till serbiska läger i Foča, där de utsattes för systematisk tortyr och avrättades.I maj 1992 införde FN ett embargo mot FRJ: detta påverkade många aspekter av livet i landet.På grund av sitt gynnsamma geografiska läge (tillgång till Adriatiska havet och en vattenförbindelse till Albanien över Skadarsjön) blev Montenegro ett nav för smugglingsverksamhet.Hela den montenegrinska industriproduktionen hade upphört, och republikens huvudsakliga ekonomiska verksamhet blev smuggling av bruksvaror – särskilt de som saknades som bensin och cigaretter, som båda skjutit i höjden i pris.Det blev en de facto legaliserad praxis och den fortsatte i flera år.I bästa fall blundade den montenegrinska regeringen för den illegala verksamheten, men mestadels deltog den aktivt i den.Smuggling gjorde miljonärer av alla möjliga skumma individer, inklusive högre regeringstjänstemän.Milo Đukanović fortsätter att utsättas för åtgärder i olika italienska domstolar för sin roll i utbredd smuggling under 1990-talet och i att ge en fristad i Montenegro för olika italienska maffiafigurer som också påstås ha deltagit i smugglingsdistributionskedjan.