Efter den elamitiska ockupationen av Babylonien såg regionen betydande politiska förändringar, som började med att Marduk-kabit-ahheshu grundade Babylonsdynastin IV runt 1155 f.Kr.Denna dynasti, som härrörde från Isin, var känd för att vara den första infödda akkadisktalande sydmesopotamiska dynastin som styrde Babylonien.Marduk-kabit-ahheshu, endast den andra infödda mesopotamien efter den assyriske kungen Tukulti-Ninurta I som styrde Babylon, fördrev framgångsrikt elamiterna och förhindrade en kassitisk väckelse.Hans regeringstid såg också konflikt med Assyrien, och intog Ekallatum innan han besegrades av Ashur-Dan I.Itti-Marduk-balatu, som efterträdde sin far 1138 f.Kr., avvärjde elamiters attacker under hans 8-åriga regeringstid.Hans försök att anfalla Assyrien slutade dock i misslyckande mot den fortfarande regerande Ashur-Dan I. Ninurta-nadin-shumi, som besteg tronen 1127 fvt, inledde också militära kampanjer mot Assyrien.Hans ambitiösa angrepp på den assyriska staden Arbela slutade i nederlag mot Ashur-resh-ishi I, som sedan införde ett fördrag som var gynnsamt för Assyrien.Nebukadnessar I (1124–1103 f.v.t.), den mest kända härskaren av denna dynasti, uppnådde betydande segrar mot Elam, återerövrade territorier och den heliga statyn av Marduk.Trots sin framgång mot Elam, stod han inför flera nederlag av Ashur-resh-ishi I i försök att expandera till territorier som tidigare kontrollerades av hettiterna.Nebukadnessar I:s senare år var fokuserade på att bygga och befästa Babylons gränser.Nebukadnessar I följdes av Enlil-nadin-apli (1103–1100 f.Kr.) och Marduk-nadin-ahhe (1098–1081 f.v.t.), som båda engagerade sig i konflikter med Assyrien.Marduk-nadin-ahhes första framgångar överskuggades av förkrossande nederlag mot Tiglath-Pileser I, vilket ledde till betydande territoriella förluster och svält i Babylon.Marduk-shapik-zeri (cirka 1072 fvt) lyckades underteckna ett fredsavtal med Assyrien, men hans efterträdare, Kadašman-Buriaš, mötte assyrisk fientlighet, vilket resulterade i assyrisk dominans fram till omkring 1050 fvt.Efterföljande babyloniska härskare som Marduk-ahhe-eriba och Marduk-zer-X var i huvudsak vasaller av Assyrien.Nedgången av det mellersta assyriska riket runt 1050 f.Kr., på grund av interna stridigheter och yttre konflikter, tillät Babylonien ett visst andrum från assyrisk kontroll.Men denna period såg också intrånget av västsemitiska nomadfolk, särskilt arameer och suteaner, som bosatte sig i stora delar av babyloniskt territorium, vilket tyder på regionens politiska och militära sårbarheter.