Током окупације, етничке тензије су биле подигнуте и национализам је растао.^[82] Британија је банкротирала и нова лабуристичка влада је желела да повуче своје снаге са истока.Али већина Малајаца се више бавила одбраном од МЦП-а него што је захтевала независност од Британаца.Године 1944, Британци су израдили планове за Малајску унију, која би претворила Савезне и Нефедеративне Малајске државе, плус Пенанг и Малаку (али не и Сингапур ), у једну крунску колонију, са погледом на независност.Овај потез, усмерен ка коначној независности, наишао је на значајан отпор Малајаца, првенствено због предложеног једнаког држављанства за етничке Кинезе и друге мањине.Британци су ове групе доживљавали као лојалније током рата него Малајци.Ово противљење довело је до распада Малајске уније 1948. године, уступајући место Федерацији Малаје, која је задржала аутономију владара Малајске државе под британском заштитом.Паралелно са овим политичким променама, Комунистичка партија Малаје (МЦП), коју су првенствено подржавали етнички Кинези, добијала је замах.МЦП, која је у почетку била легална странка, окренула се ка герилском рату са тежњама да протера Британце из Малаје.До јула 1948. године, британска влада је прогласила ванредно стање, што је навело МЦП да се повуче у џунглу и формира Малајску народноослободилачку армију.Основни узроци овог сукоба кретали су се од уставних промена које су маргинализовале етничке Кинезе до расељавања сељака ради развоја плантажа.Међутим, МЦП је добио минималну подршку глобалних комунистичких сила.Малајска ванредна ситуација, која је трајала од 1948. до 1960. године, довела је до тога да Британци користе модерну тактику против побуњеника, коју је осмислио генерал-потпуковник Сир Гералд Темплер, против МЦП-а.Док је сукоб имао свој удео у злочинима, као што је масакр у Батанг Калију, британска стратегија изоловања МЦП-а од његове базе подршке, заједно са економским и политичким уступцима, постепено је ослабила побуњенике.До средине 1950-их, плима се окренула против МЦП-а, постављајући терен за независност Федерације у оквиру Комонвелта 31. августа 1957. године, са Тунку Абдул Рахманом као њеним инаугурационим премијером.