В 16 веке протестантские движения Реформации глубоко проникли в польское христианство, и в результате Реформация в Польше охватила ряд различных конфессий.Политика религиозной терпимости, разработанная в Польше, была почти уникальной для Европы того времени, и многие, кто бежал из регионов, раздираемых религиозными распрями, нашли убежище в Польше.Правление короля Сигизмунда I Старого (1506–1548) и короля Сигизмунда II Августа (1548–1572) стало свидетелем интенсивного развития культуры и науки (золотой век Ренессанса в Польше), из которых астроном Николай Коперник (1473 г. –1543) – самый известный представитель.Ян Кохановский (1530–1584) был поэтом и выдающейся творческой личностью того периода.В 1525 году, во время правления Сигизмунда I, Тевтонский орден был секуляризован, и герцог Альберт совершил акт почтения перед польским королем (прусское почтение) в отношении своего вотчины, герцогства Пруссии.Мазовия окончательно вошла в состав Польской короны в 1529 году.Правление Сигизмунда II завершило ягеллонский период, но привело к Люблинской унии (1569 г.), окончательному завершению унии с Литвой.Этот договор передал Украину из состава Великого княжества Литовского Польше и превратил польско-литовское государство в настоящий союз, сохранив его после смерти бездетного Сигизмунда II, активное участие которого сделало возможным завершение этого процесса.Ливония на крайнем северо-востоке была присоединена к Польше в 1561 году, и Польша вступила в Ливонскую войну против царства России .Движение палачей, которое пыталось остановить прогрессирующее господство в государстве магнатских семей Польши и Литвы, достигло пика на сейме в Петркуве в 1562–63.На религиозном фронте польские братья отделились от кальвинистов, и в 1563 г. была опубликована протестантская Брестская Библия. Иезуитам, прибывшим в 1564 г., суждено было оказать большое влияние на историю Польши.