Ved stortingsvalget i 1990 fikk den høyreekstreme konservative alliansen, Den islamske demokratiske alliansen (IDA) ledet av Nawaz Sharif, nok støtte til å danne en regjering.Dette markerte første gang en høyreorientert konservativ allianse overtok makten under et demokratisk system i Pakistan.Sharifs administrasjon fokuserte på å adressere landets stagflasjon ved å implementere politikk for privatisering og økonomisk liberalisering.I tillegg opprettholdt regjeringen hans en tvetydighetspolitikk angående Pakistans atombombeprogrammer.I løpet av sin periode involverte Sharif Pakistan i Gulfkrigen i 1991 og satte i gang en militæroperasjon mot liberale styrker i Karachi i 1992. Imidlertid sto hans regjering overfor institusjonelle utfordringer, spesielt med president Ghulam Khan.Khan forsøkte å avskjedige Sharif ved å bruke lignende anklager som han tidligere hadde reist mot Benazir Bhutto.Sharif ble opprinnelig kastet ut, men ble gjenopprettet til makten etter en høyesterettsdom.I en politisk manøver samarbeidet Sharif og Bhutto for å fjerne president Khan fra vervet.Til tross for dette var Sharifs periode kortvarig, da han til slutt ble tvunget til å trekke seg på grunn av press fra den militære ledelsen.