Perioden frem til Ayub Khans erklæring om krigslov i Pakistan var preget av politisk ustabilitet og sekterisk politikk.Regjeringen, som ble oppfattet som sviktende i sin styring, sto overfor problemer som uløste kanalvanntvister som påvirket den landbruksavhengige økonomien, og utfordringer med å håndtere den indiske tilstedeværelsen i Jammu og Kashmir.I 1956 gikk Pakistan over fra et britisk herredømme til en islamsk republikk med en ny grunnlov, og generalmajor Iskander Mirza ble den første presidenten.Imidlertid så denne perioden betydelig politisk uro og en rask rekkefølge av fire statsministre i løpet av to år, noe som ytterligere agiterte befolkningen og militæret.Mirzas kontroversielle bruk av makt, spesielt hans One Unit-ordning som slo sammen Pakistans provinser i to fløyer, Øst- og Vest-Pakistan, var politisk splittende og vanskelig å implementere.Denne uroen og Mirzas handlinger førte til en tro i militæret på at et kupp ville bli støttet av offentligheten, og banet vei for Ayub Khan å ta kontroll.Den 7. oktober erklærte president Mirza krigslov, opphevet grunnloven fra 1956, avskjediget regjeringen, oppløste lovgivende organer og forbød politiske partier.Han utnevnte general Ayub Khan til sjef for kamplovsadministrator og foreslo ham som ny statsminister.Både Mirza og Ayub Khan så på hverandre som konkurrenter om makten.Mirza, som følte at rollen hans ble overflødig etter at Ayub Khan hadde overtatt flertallet av den utøvende myndigheten som sjef for krigslovsadministrator og statsminister, prøvde å hevde sin posisjon på nytt.Omvendt mistenkte Ayub Khan Mirza for å planlegge mot ham.Etter sigende ble Ayub Khan informert om Mirzas intensjon om å arrestere ham når han kom tilbake fra Dhaka.Til syvende og sist antas det generelt at Ayub Khan, med støtte fra lojale generaler, tvang Mirza til å trekke seg.^[14] Etter dette ble Mirza opprinnelig ført til Quetta, Baluchistans hovedstad, og deretter sendt i eksil til London, England, 27. november, hvor han bodde til han gikk bort i 1969.Militærkuppet ble opprinnelig ønsket velkommen i Pakistan som et pusterom fra ustabilt styresett, med håp om økonomisk stabilisering og politisk modernisering.Ayub Khans regime fikk støtte fra utenlandske regjeringer, inkludert USA .^[15] Han kombinerte rollene som president og statsminister, og dannet et kabinett av teknokrater, militæroffiserer og diplomater.Ayub Khan utnevnte general Muhammad Musa til den nye hærsjefen og sikret rettslig validering for hans overtakelse under «Nødvendighetsdoktrinen».