I 538 fvt erobret Kyros den store fra Achaemenid-riket Babylon og innlemmet det i sitt imperium.Hans utstedelse av en proklamasjon, Kyros-ediktet, ga religionsfrihet til dem under babylonsk styre.Dette gjorde det mulig for jødiske eksil i Babylon, inkludert 50 000 judeere ledet av Serubabel, til å vende tilbake til Juda og gjenoppbygge Jerusalems tempel, ferdigstilt rundt 515 fvt.^[80] I tillegg, i 456 fvt, kom en annen gruppe på 5000, ledet av Esra og Nehemia, tilbake;førstnevnte fikk i oppgave av den persiske kongen å håndheve religiøse regler, mens sistnevnte ble utnevnt til guvernør med et oppdrag om å gjenopprette byens murer.^[81] Yehud, som regionen ble kjent, forble en Achaemenid-provins frem til 332 fvt.Torahens endelige tekst, som tilsvarer de fem første bøkene i Bibelen, antas å ha blitt kompilert i løpet av den persiske perioden (rundt 450–350 fvt), gjennom redigering og forening av tidligere tekster.^[82] De hjemvendte israelittene adopterte en arameisk skrift fra Babylon, nå den moderne hebraiske skriften, og den hebraiske kalenderen, som ligner den babylonske kalenderen, stammer sannsynligvis fra denne perioden.^[83]Bibelen forteller om spenningen mellom de hjemvendte, eliten fra Første Tempel-perioden ^[84] , og de som oppholdt seg i Juda.^[85] De hjemvendte, muligens støttet av det persiske monarkiet, kan ha blitt betydelige grunneiere, til skade for de som hadde fortsatt å arbeide med landet i Juda.Deres motstand mot Det andre tempelet kan reflektere frykt for å miste landrettigheter på grunn av ekskludering fra kulten.^[84] Juda ble effektivt et teokrati, ledet av arvelige yppersteprester ^[86] og en persisk-utnevnt, ofte jødisk, guvernør som var ansvarlig for å opprettholde orden og sørge for utbetalinger av skatt.^[87] Betydelig nok ble en jødisk militærgarnison stasjonert av perserne på Elephantine Island nær Aswan iEgypt .