Etter den elamittiske okkupasjonen av Babylonia, så regionen betydelige politiske endringer, som startet med at Marduk-kabit-ahheshu grunnla Dynastiet IV av Babylon rundt 1155 fvt.Dette dynastiet, som stammer fra Isin, var kjent for å være det første innfødte akkadisk-talende sør-mesopotamiske dynastiet som styrte Babylonia.Marduk-kabit-ahheshu, bare den andre innfødte mesopotamieren etter den assyriske kongen Tukulti-Ninurta I som styrte Babylon, utviste med hell elamittene og forhindret en kassittisk vekkelse.Hans regjeringstid så også konflikt med Assyria, og fanget Ekallatum før han ble beseiret av Ashur-Dan I.Itti-Marduk-balatu, som etterfulgte sin far i 1138 fvt, avverget elamittangrep under hans 8 år lange regjeringstid.Hans forsøk på å angripe Assyria endte imidlertid i fiasko mot den fortsatt regjerende Ashur-Dan I. Ninurta-nadin-shumi, som besteg tronen i 1127 fvt., startet også militære kampanjer mot Assyria.Hans ambisiøse angrep på den assyriske byen Arbela endte i nederlag av Ashur-resh-ishi I, som deretter innførte en traktat som var gunstig for Assyria.Nebukadnesar I (1124–1103 f.v.t.), den mest kjente herskeren av dette dynastiet, oppnådde betydelige seire mot Elam, gjenvunnet territorier og den hellige statuen av Marduk.Til tross for suksessen mot Elam, møtte han flere nederlag av Ashur-resh-ishi I i forsøk på å utvide seg til territorier som tidligere var kontrollert av hettittene.Nebukadnesar I sine senere år var fokusert på bygging og befestning av Babylons grenser.Nebuchadnezzar I ble fulgt av Enlil-nadin-apli (1103–1100 fvt) og Marduk-nadin-ahhe (1098–1081 fvt), som begge engasjerte seg i konflikter med Assyria.Marduk-nadin-ahhes første suksesser ble overskygget av knusende nederlag av Tiglath-Pileser I, noe som førte til betydelige territorielle tap og hungersnød i Babylon.Marduk-shapik-zeri (ca. 1072 fvt.) klarte å signere en fredsavtale med Assyria, men hans etterfølger, Kadašman-Buriaš, møtte assyrisk fiendtlighet, noe som resulterte i assyrisk dominans til rundt 1050 fvt.Påfølgende babylonske herskere som Marduk-ahhe-eriba og Marduk-zer-X var i hovedsak vasaller av Assyria.Nedgangen til det midt-assyriske riket rundt 1050 fvt, på grunn av interne stridigheter og eksterne konflikter, tillot Babylonia noe pusterom fra assyrisk kontroll.Imidlertid så denne perioden også inntoget av vestsemittiske nomadiske folk, spesielt arameere og suteere, som slo seg ned i store deler av babylonsk territorium, noe som indikerer regionens politiske og militære sårbarheter.