Athenerne falt nå tilbake til øya Prosopitis i Nildeltaet, hvor skipene deres lå fortøyd.Der beleiret Megabyzus dem i 18 måneder, helt til han til slutt var i stand til å drenere elven fra rundt øya ved å grave kanaler, og dermed "føye øya til fastlandet".I Thukydides beretning krysset perserne deretter over til den tidligere øya og fanget den.Bare noen få av den athenske styrken, som marsjerte gjennom Libya til Kyrene, overlevde for å returnere til Athen.I Diodorus sin versjon fikk imidlertid dreneringen av elven egypterne (som Thukydides ikke nevner) til å hoppe av og overgi seg til perserne.Perserne, som ikke ønsket å bære store skader ved å angripe athenerne, lot dem i stedet reise fritt til Kyrene, hvorfra de returnerte til Athen.Siden nederlaget til den egyptiske ekspedisjonen forårsaket en genuin panikk i Athen, inkludert flyttingen av Delian-skattkammeret til Athen, er det sannsynligvis mer sannsynlig at Thukydides versjon er korrekt.