Med nederlaget til den joniske flåten i slaget ved Lade, var opprøret effektivt over.Miletus var tett investert, perserne "gruvede veggene og brukte hver enhet mot den, til de fanget den fullstendig".I følge Herodot ble de fleste mennene drept, og kvinnene og barna ble gjort til slaver.Arkeologiske bevis underbygger delvis dette, og viser utbredte tegn på ødeleggelse og forlatelse av store deler av byen i kjølvannet av Lade.Imidlertid forble noen milesere i (eller kom raskt tilbake til) Milet, selv om byen aldri ville gjenerobre sin tidligere storhet.Miletus ble dermed teoretisk "latt stå tom for milesere";perserne tok byen og kystlandet for seg selv, og ga resten av det milesiske territoriet til karerne fra Pedasus.De fangede mileserne ble brakt for Darius i Susa, som bosatte dem ved "Ampé" på kysten av Persiabukta, nær munningen av Tigris.Mange samer ble forferdet over handlingene til generalene deres ved Lade, og bestemte seg for å emigrere før deres gamle tyrann, Aeaces of Samos, kom tilbake for å styre dem.De tok imot en invitasjon fra folket i Zancle om å bosette seg på kysten av Sicilia, og tok med seg mileserne som hadde klart å rømme fra perserne.Samos selv ble spart for ødeleggelse av perserne på grunn av samisk avhopp ved Lade.Det meste av Caria overga seg nå til perserne, selv om noen festninger måtte erobres med makt.