Den siste krigen i Ivans regjeringstid ble satt i gang av Ilhams enke, som giftet seg med Moxammat Amin og overtalte ham til å hevde sin uavhengighet fra Moskva i 1505. Opprøret brøt ut i det fri på Johannesdagen, da tatarene massakrerte russiske kjøpmenn og utsendinger til stede kl. den årlige Kazan-messen.En enorm hær av Kazan- og Nogai-tatarene rykket deretter frem mot Nizhny Novgorod og beleiret byen.Affæren ble avgjort av 300 litauiske bueskyttere, som hadde blitt tatt til fange av russere i slaget ved Vedrosha og bodde i Nizjnij i fangenskap.De klarte å sette den tatariske fortroppen i uorden: khans svoger ble drept i aksjon og horden trakk seg tilbake.Ivans død hindret fiendtlighetene i å bli fornyet til mai 1506, da prins Fjodor Belsky ledet russiske styrker mot Kazan.Etter at det tatariske kavaleriet angrep hans bakdel, tok mange russere flukt eller druknet i Foul Lake (22. mai).Prins Vasily Kholmsky ble sendt for å avlaste Belsky og beseiret khanen på Arsk-feltet 22. juni. Moxammat Amin trakk seg tilbake til Arsk-tårnet, men da russerne begynte å feire seieren, våget han seg ut og påførte dem et uutholdelig nederlag (25. juni) .Selv om det var den mest strålende tatariske seieren på flere tiår, besluttet Moxammat Amin – av en eller annen grunn ikke klart forstått – å saksøke for fred og hyllet Ivans etterfølger, Vasilij III av Russland.