Ved første lys den 20. juni marsjerte Taira-hæren stille opp til Byodo-in, skjult av tykk tåke.Minamotoene hørte plutselig Taira-krigsropet og svarte med sitt eget.En voldsom kamp fulgte, med munker og samurai som skjøt piler gjennom tåken mot hverandre.Soldater fra Tairas allierte, Ashikaga, forserte elven og presset på angrepet.Prins Mochihito prøvde å rømme til Nara i kaoset, men Taira fanget ham og henrettet ham.Nara-munkene som marsjerte mot Byodo-in hørte at de var for sene til å hjelpe Minamoto, og snudde tilbake.Minamoto Yorimasa begikk i mellomtiden den første klassiske seppukuen i historien, skrev et dødsdikt på krigsfanen sin, og skar deretter opp sitt eget underliv.Det første slaget ved Uji er kjent og viktig for å ha åpnet Genpei-krigen.